Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTGFP29279 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CTGFP29279 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTGFP29279 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CTGFP29279 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CTGFP29279 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTGFP29279 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTGFP29279 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CTGFP29279 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTGFP29279 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTGFP29279 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTGFP29279 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CTGFP29279 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTGFP29279 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTGFP29279 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTGFP29279 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTGFP29279 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTGFP29279 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTGFP29279 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTGFP29279 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTGFP29279 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTGFP29279 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTGFP29279 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTGFP29279 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTGFP29279 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTGFP29279 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTGFP29279 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CTGFP29279 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CTGFP29279 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTGFP29279 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTGFP29279 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTGFP29279 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTGFP29279 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTGFP29279 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTGFP29279 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTGFP29279 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTGFP29279 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTGFP29279 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTGFP29279 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTGFP29279 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTGFP29279 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CTGFP29279 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTGFP29279 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CTGFP29279 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTGFP29279 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTGFP29279 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTGFP29279 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CTGFP29279 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTGFP29279 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CTGFP29279 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTGFP29279 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTGFP29279 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTGFP29279 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTGFP29279 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTGFP29279 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTGFP29279 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTGFP29279 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTGFP29279 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTGFP29279 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTGFP29279 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTGFP29279 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTGFP29279 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTGFP29279 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTGFP29279 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTGFP29279 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTGFP29279 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTGFP29279 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTGFP29279 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTGFP29279 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTGFP29279 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTGFP29279 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CTGFP29279 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CTGFP29279 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CTGFP29279 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CTGFP29279 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTGFP29279 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTGFP29279 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CTGFP29279 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTGFP29279 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTGFP29279 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTGFP29279 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTGFP29279 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTGFP29279 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CTGFP29279 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTGFP29279 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTGFP29279 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTGFP29279 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTGFP29279 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTGFP29279 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTGFP29279 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTGFP29279 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTGFP29279 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CTGFP29279 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CTGFP29279 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CTGFP29279 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTGFP29279 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTGFP29279 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTGFP29279 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTGFP29279 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTGFP29279 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms