Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALB2P22676 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALB2P22676 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALB2P22676 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALB2P22676 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALB2P22676 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CALB2P22676 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALB2P22676 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALB2P22676 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALB2P22676 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALB2P22676 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALB2P22676 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALB2P22676 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALB2P22676 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALB2P22676 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALB2P22676 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALB2P22676 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALB2P22676 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALB2P22676 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALB2P22676 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALB2P22676 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALB2P22676 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALB2P22676 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALB2P22676 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALB2P22676 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALB2P22676 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALB2P22676 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CALB2P22676 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CALB2P22676 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALB2P22676 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALB2P22676 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALB2P22676 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALB2P22676 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALB2P22676 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALB2P22676 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALB2P22676 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALB2P22676 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALB2P22676 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALB2P22676 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALB2P22676 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALB2P22676 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALB2P22676 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALB2P22676 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALB2P22676 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALB2P22676 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALB2P22676 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALB2P22676 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALB2P22676 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALB2P22676 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALB2P22676 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALB2P22676 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALB2P22676 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALB2P22676 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALB2P22676 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CALB2P22676 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALB2P22676 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALB2P22676 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALB2P22676 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALB2P22676 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALB2P22676 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALB2P22676 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALB2P22676 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CALB2P22676 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALB2P22676 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALB2P22676 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CALB2P22676 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALB2P22676 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALB2P22676 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALB2P22676 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALB2P22676 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALB2P22676 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALB2P22676 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALB2P22676 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALB2P22676 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALB2P22676 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALB2P22676 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALB2P22676 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALB2P22676 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALB2P22676 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CALB2P22676 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALB2P22676 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALB2P22676 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALB2P22676 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALB2P22676 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALB2P22676 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CALB2P22676 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALB2P22676 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALB2P22676 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALB2P22676 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALB2P22676 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALB2P22676 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALB2P22676 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALB2P22676 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALB2P22676 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALB2P22676 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALB2P22676 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALB2P22676 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALB2P22676 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALB2P22676 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALB2P22676 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms