Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTNP21246 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTNP21246 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTNP21246 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTNP21246 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTNP21246 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTNP21246 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTNP21246 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTNP21246 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTNP21246 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTNP21246 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTNP21246 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTNP21246 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTNP21246 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTNP21246 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTNP21246 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTNP21246 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTNP21246 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTNP21246 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTNP21246 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTNP21246 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTNP21246 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTNP21246 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTNP21246 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTNP21246 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTNP21246 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTNP21246 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTNP21246 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTNP21246 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTNP21246 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTNP21246 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTNP21246 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTNP21246 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTNP21246 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTNP21246 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTNP21246 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTNP21246 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTNP21246 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTNP21246 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTNP21246 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTNP21246 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTNP21246 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PTNP21246 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTNP21246 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTNP21246 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTNP21246 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTNP21246 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTNP21246 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTNP21246 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTNP21246 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTNP21246 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTNP21246 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTNP21246 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTNP21246 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTNP21246 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTNP21246 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTNP21246 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTNP21246 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTNP21246 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTNP21246 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTNP21246 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTNP21246 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTNP21246 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTNP21246 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTNP21246 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTNP21246 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTNP21246 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTNP21246 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTNP21246 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTNP21246 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTNP21246 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTNP21246 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTNP21246 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTNP21246 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTNP21246 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTNP21246 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTNP21246 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTNP21246 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTNP21246 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTNP21246 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTNP21246 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTNP21246 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTNP21246 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTNP21246 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTNP21246 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTNP21246 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTNP21246 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTNP21246 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTNP21246 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTNP21246 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTNP21246 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTNP21246 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTNP21246 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTNP21246 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTNP21246 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTNP21246 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTNP21246 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTNP21246 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTNP21246 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTNP21246 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms