Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF1BP20333 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF1BP20333 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF1BP20333 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF1BP20333 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF1BP20333 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF1BP20333 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF1BP20333 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF1BP20333 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF1BP20333 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF1BP20333 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF1BP20333 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF1BP20333 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TNFRSF1BP20333 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF1BP20333 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF1BP20333 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF1BP20333 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF1BP20333 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF1BP20333 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF1BP20333 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF1BP20333 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF1BP20333 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF1BP20333 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF1BP20333 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF1BP20333 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF1BP20333 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF1BP20333 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF1BP20333 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF1BP20333 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF1BP20333 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF1BP20333 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF1BP20333 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF1BP20333 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF1BP20333 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF1BP20333 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF1BP20333 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF1BP20333 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF1BP20333 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF1BP20333 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF1BP20333 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF1BP20333 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF1BP20333 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF1BP20333 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF1BP20333 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF1BP20333 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF1BP20333 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF1BP20333 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF1BP20333 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF1BP20333 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF1BP20333 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF1BP20333 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF1BP20333 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF1BP20333 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF1BP20333 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF1BP20333 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF1BP20333 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF1BP20333 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF1BP20333 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF1BP20333 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF1BP20333 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF1BP20333 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF1BP20333 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF1BP20333 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF1BP20333 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF1BP20333 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF1BP20333 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF1BP20333 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF1BP20333 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF1BP20333 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF1BP20333 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF1BP20333 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF1BP20333 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF1BP20333 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF1BP20333 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF1BP20333 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF1BP20333 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF1BP20333 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF1BP20333 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF1BP20333 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF1BP20333 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF1BP20333 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF1BP20333 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF1BP20333 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF1BP20333 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF1BP20333 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF1BP20333 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF1BP20333 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF1BP20333 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF1BP20333 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF1BP20333 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF1BP20333 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF1BP20333 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF1BP20333 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF1BP20333 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF1BP20333 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF1BP20333 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF1BP20333 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF1BP20333 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF1BP20333 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF1BP20333 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms