Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VCAM1P19320 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VCAM1P19320 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VCAM1P19320 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VCAM1P19320 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VCAM1P19320 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VCAM1P19320 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VCAM1P19320 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VCAM1P19320 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VCAM1P19320 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VCAM1P19320 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VCAM1P19320 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
VCAM1P19320 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
VCAM1P19320 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
VCAM1P19320 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VCAM1P19320 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
VCAM1P19320 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VCAM1P19320 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VCAM1P19320 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
VCAM1P19320 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VCAM1P19320 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VCAM1P19320 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
VCAM1P19320 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
VCAM1P19320 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VCAM1P19320 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VCAM1P19320 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VCAM1P19320 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VCAM1P19320 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VCAM1P19320 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VCAM1P19320 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VCAM1P19320 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
VCAM1P19320 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VCAM1P19320 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
VCAM1P19320 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VCAM1P19320 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VCAM1P19320 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
VCAM1P19320 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VCAM1P19320 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VCAM1P19320 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VCAM1P19320 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VCAM1P19320 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VCAM1P19320 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VCAM1P19320 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VCAM1P19320 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
VCAM1P19320 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VCAM1P19320 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VCAM1P19320 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VCAM1P19320 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VCAM1P19320 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VCAM1P19320 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
VCAM1P19320 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VCAM1P19320 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
VCAM1P19320 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VCAM1P19320 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VCAM1P19320 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VCAM1P19320 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VCAM1P19320 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VCAM1P19320 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VCAM1P19320 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VCAM1P19320 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VCAM1P19320 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VCAM1P19320 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
VCAM1P19320 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VCAM1P19320 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VCAM1P19320 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VCAM1P19320 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VCAM1P19320 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VCAM1P19320 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VCAM1P19320 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VCAM1P19320 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VCAM1P19320 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VCAM1P19320 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VCAM1P19320 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VCAM1P19320 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VCAM1P19320 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VCAM1P19320 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
VCAM1P19320 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VCAM1P19320 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VCAM1P19320 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VCAM1P19320 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VCAM1P19320 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VCAM1P19320 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
VCAM1P19320 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
VCAM1P19320 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
VCAM1P19320 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VCAM1P19320 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VCAM1P19320 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VCAM1P19320 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VCAM1P19320 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VCAM1P19320 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
VCAM1P19320 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
VCAM1P19320 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VCAM1P19320 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VCAM1P19320 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VCAM1P19320 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VCAM1P19320 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VCAM1P19320 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VCAM1P19320 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VCAM1P19320 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VCAM1P19320 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms