Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC2P18074 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC2P18074 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC2P18074 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC2P18074 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC2P18074 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC2P18074 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC2P18074 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC2P18074 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC2P18074 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC2P18074 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC2P18074 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC2P18074 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC2P18074 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC2P18074 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC2P18074 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC2P18074 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC2P18074 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC2P18074 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC2P18074 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC2P18074 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC2P18074 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC2P18074 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERCC2P18074 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERCC2P18074 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
ERCC2P18074 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC2P18074 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC2P18074 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC2P18074 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC2P18074 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC2P18074 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC2P18074 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC2P18074 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC2P18074 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC2P18074 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC2P18074 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC2P18074 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC2P18074 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC2P18074 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC2P18074 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC2P18074 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC2P18074 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC2P18074 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC2P18074 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC2P18074 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC2P18074 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC2P18074 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC2P18074 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC2P18074 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC2P18074 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC2P18074 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC2P18074 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC2P18074 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC2P18074 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC2P18074 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC2P18074 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC2P18074 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC2P18074 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC2P18074 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC2P18074 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms