Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GM2AP17900 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GM2AP17900 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GM2AP17900 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GM2AP17900 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GM2AP17900 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GM2AP17900 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GM2AP17900 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GM2AP17900 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GM2AP17900 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GM2AP17900 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GM2AP17900 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GM2AP17900 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GM2AP17900 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GM2AP17900 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GM2AP17900 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GM2AP17900 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GM2AP17900 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GM2AP17900 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GM2AP17900 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GM2AP17900 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GM2AP17900 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GM2AP17900 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GM2AP17900 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GM2AP17900 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GM2AP17900 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GM2AP17900 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GM2AP17900 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GM2AP17900 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GM2AP17900 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GM2AP17900 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GM2AP17900 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GM2AP17900 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GM2AP17900 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GM2AP17900 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GM2AP17900 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GM2AP17900 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GM2AP17900 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GM2AP17900 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GM2AP17900 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GM2AP17900 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GM2AP17900 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GM2AP17900 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GM2AP17900 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GM2AP17900 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GM2AP17900 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GM2AP17900 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GM2AP17900 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GM2AP17900 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GM2AP17900 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GM2AP17900 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GM2AP17900 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GM2AP17900 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GM2AP17900 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GM2AP17900 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GM2AP17900 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GM2AP17900 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GM2AP17900 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GM2AP17900 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GM2AP17900 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GM2AP17900 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GM2AP17900 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GM2AP17900 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GM2AP17900 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GM2AP17900 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GM2AP17900 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GM2AP17900 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GM2AP17900 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GM2AP17900 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GM2AP17900 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GM2AP17900 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GM2AP17900 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GM2AP17900 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GM2AP17900 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GM2AP17900 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GM2AP17900 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GM2AP17900 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GM2AP17900 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GM2AP17900 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GM2AP17900 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GM2AP17900 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GM2AP17900 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GM2AP17900 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GM2AP17900 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GM2AP17900 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GM2AP17900 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GM2AP17900 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GM2AP17900 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GM2AP17900 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GM2AP17900 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GM2AP17900 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GM2AP17900 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GM2AP17900 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GM2AP17900 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GM2AP17900 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GM2AP17900 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GM2AP17900 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GM2AP17900 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GM2AP17900 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GM2AP17900 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms