Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GOT1P17174 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOT1P17174 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOT1P17174 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOT1P17174 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOT1P17174 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOT1P17174 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GOT1P17174 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GOT1P17174 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GOT1P17174 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOT1P17174 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOT1P17174 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOT1P17174 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOT1P17174 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOT1P17174 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOT1P17174 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOT1P17174 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOT1P17174 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOT1P17174 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOT1P17174 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOT1P17174 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOT1P17174 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOT1P17174 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOT1P17174 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOT1P17174 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOT1P17174 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOT1P17174 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOT1P17174 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOT1P17174 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOT1P17174 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOT1P17174 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOT1P17174 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOT1P17174 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOT1P17174 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GOT1P17174 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOT1P17174 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOT1P17174 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOT1P17174 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOT1P17174 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOT1P17174 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOT1P17174 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOT1P17174 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOT1P17174 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOT1P17174 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOT1P17174 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOT1P17174 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOT1P17174 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOT1P17174 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOT1P17174 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOT1P17174 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOT1P17174 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOT1P17174 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOT1P17174 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOT1P17174 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOT1P17174 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOT1P17174 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOT1P17174 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOT1P17174 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOT1P17174 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOT1P17174 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOT1P17174 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOT1P17174 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOT1P17174 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOT1P17174 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GOT1P17174 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOT1P17174 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOT1P17174 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOT1P17174 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOT1P17174 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOT1P17174 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOT1P17174 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOT1P17174 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOT1P17174 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GOT1P17174 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOT1P17174 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOT1P17174 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOT1P17174 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOT1P17174 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOT1P17174 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOT1P17174 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOT1P17174 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOT1P17174 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOT1P17174 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOT1P17174 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOT1P17174 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOT1P17174 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOT1P17174 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOT1P17174 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOT1P17174 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOT1P17174 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOT1P17174 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOT1P17174 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOT1P17174 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GOT1P17174 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOT1P17174 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOT1P17174 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOT1P17174 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOT1P17174 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOT1P17174 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOT1P17174 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms