Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CEACAM1P13688 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEACAM1P13688 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEACAM1P13688 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CEACAM1P13688 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEACAM1P13688 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEACAM1P13688 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEACAM1P13688 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEACAM1P13688 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEACAM1P13688 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEACAM1P13688 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEACAM1P13688 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEACAM1P13688 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEACAM1P13688 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CEACAM1P13688 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEACAM1P13688 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEACAM1P13688 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEACAM1P13688 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEACAM1P13688 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEACAM1P13688 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEACAM1P13688 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEACAM1P13688 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEACAM1P13688 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEACAM1P13688 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEACAM1P13688 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEACAM1P13688 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEACAM1P13688 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEACAM1P13688 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEACAM1P13688 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEACAM1P13688 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEACAM1P13688 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEACAM1P13688 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEACAM1P13688 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEACAM1P13688 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEACAM1P13688 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEACAM1P13688 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEACAM1P13688 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEACAM1P13688 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEACAM1P13688 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEACAM1P13688 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEACAM1P13688 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEACAM1P13688 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEACAM1P13688 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEACAM1P13688 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CEACAM1P13688 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEACAM1P13688 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEACAM1P13688 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CEACAM1P13688 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEACAM1P13688 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEACAM1P13688 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEACAM1P13688 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEACAM1P13688 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEACAM1P13688 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEACAM1P13688 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEACAM1P13688 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CEACAM1P13688 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEACAM1P13688 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEACAM1P13688 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEACAM1P13688 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEACAM1P13688 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEACAM1P13688 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CEACAM1P13688 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEACAM1P13688 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms