Protein–RNA interactions for Protein: P13647

KRT5, Keratin, type II cytoskeletal 5, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT5P13647 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT5P13647 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT5P13647 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT5P13647 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT5P13647 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT5P13647 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT5P13647 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT5P13647 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT5P13647 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT5P13647 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT5P13647 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT5P13647 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT5P13647 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT5P13647 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT5P13647 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT5P13647 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT5P13647 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT5P13647 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT5P13647 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT5P13647 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT5P13647 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT5P13647 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT5P13647 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT5P13647 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT5P13647 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT5P13647 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT5P13647 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT5P13647 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT5P13647 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT5P13647 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT5P13647 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT5P13647 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT5P13647 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT5P13647 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT5P13647 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT5P13647 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT5P13647 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT5P13647 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT5P13647 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT5P13647 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT5P13647 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT5P13647 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT5P13647 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT5P13647 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT5P13647 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT5P13647 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT5P13647 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT5P13647 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT5P13647 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT5P13647 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT5P13647 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT5P13647 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT5P13647 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT5P13647 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT5P13647 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT5P13647 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT5P13647 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT5P13647 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT5P13647 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT5P13647 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT5P13647 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT5P13647 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT5P13647 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT5P13647 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT5P13647 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT5P13647 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT5P13647 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT5P13647 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT5P13647 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT5P13647 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT5P13647 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT5P13647 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT5P13647 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT5P13647 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KRT5P13647 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT5P13647 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT5P13647 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT5P13647 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT5P13647 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT5P13647 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT5P13647 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT5P13647 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT5P13647 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT5P13647 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT5P13647 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT5P13647 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT5P13647 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT5P13647 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT5P13647 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT5P13647 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT5P13647 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT5P13647 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT5P13647 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT5P13647 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT5P13647 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT5P13647 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT5P13647 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT5P13647 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT5P13647 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT5P13647 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms