Protein–RNA interactions for Protein: P13385

TDGF1, Teratocarcinoma-derived growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDGF1P13385 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TDGF1P13385 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TDGF1P13385 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TDGF1P13385 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TDGF1P13385 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TDGF1P13385 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TDGF1P13385 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TDGF1P13385 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TDGF1P13385 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TDGF1P13385 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TDGF1P13385 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TDGF1P13385 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TDGF1P13385 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TDGF1P13385 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TDGF1P13385 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TDGF1P13385 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TDGF1P13385 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TDGF1P13385 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TDGF1P13385 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TDGF1P13385 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TDGF1P13385 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TDGF1P13385 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TDGF1P13385 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TDGF1P13385 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TDGF1P13385 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TDGF1P13385 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TDGF1P13385 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TDGF1P13385 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TDGF1P13385 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TDGF1P13385 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TDGF1P13385 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TDGF1P13385 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TDGF1P13385 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TDGF1P13385 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TDGF1P13385 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDGF1P13385 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDGF1P13385 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDGF1P13385 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDGF1P13385 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDGF1P13385 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TDGF1P13385 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDGF1P13385 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDGF1P13385 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TDGF1P13385 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TDGF1P13385 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TDGF1P13385 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TDGF1P13385 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TDGF1P13385 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TDGF1P13385 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TDGF1P13385 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TDGF1P13385 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TDGF1P13385 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TDGF1P13385 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TDGF1P13385 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TDGF1P13385 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TDGF1P13385 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TDGF1P13385 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TDGF1P13385 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TDGF1P13385 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TDGF1P13385 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TDGF1P13385 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TDGF1P13385 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TDGF1P13385 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TDGF1P13385 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TDGF1P13385 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TDGF1P13385 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TDGF1P13385 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TDGF1P13385 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TDGF1P13385 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TDGF1P13385 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TDGF1P13385 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TDGF1P13385 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TDGF1P13385 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TDGF1P13385 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TDGF1P13385 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TDGF1P13385 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TDGF1P13385 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TDGF1P13385 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TDGF1P13385 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDGF1P13385 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDGF1P13385 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDGF1P13385 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TDGF1P13385 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TDGF1P13385 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TDGF1P13385 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TDGF1P13385 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TDGF1P13385 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TDGF1P13385 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TDGF1P13385 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TDGF1P13385 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TDGF1P13385 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TDGF1P13385 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TDGF1P13385 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TDGF1P13385 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TDGF1P13385 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDGF1P13385 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDGF1P13385 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDGF1P13385 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDGF1P13385 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDGF1P13385 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.3 ms