Protein–RNA interactions for Protein: P10827

THRA, Thyroid hormone receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP10827 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
THRAP10827 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
THRAP10827 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
THRAP10827 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
THRAP10827 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
THRAP10827 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
THRAP10827 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
THRAP10827 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
THRAP10827 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
THRAP10827 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
THRAP10827 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
THRAP10827 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
THRAP10827 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THRAP10827 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
THRAP10827 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THRAP10827 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THRAP10827 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THRAP10827 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
THRAP10827 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
THRAP10827 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
THRAP10827 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THRAP10827 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
THRAP10827 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
THRAP10827 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
THRAP10827 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
THRAP10827 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
THRAP10827 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
THRAP10827 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
THRAP10827 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
THRAP10827 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
THRAP10827 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
THRAP10827 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
THRAP10827 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
THRAP10827 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
THRAP10827 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
THRAP10827 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THRAP10827 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
THRAP10827 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THRAP10827 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
THRAP10827 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THRAP10827 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THRAP10827 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THRAP10827 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THRAP10827 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THRAP10827 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
THRAP10827 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THRAP10827 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
THRAP10827 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
THRAP10827 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THRAP10827 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
THRAP10827 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THRAP10827 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THRAP10827 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THRAP10827 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
THRAP10827 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
THRAP10827 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
THRAP10827 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THRAP10827 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THRAP10827 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THRAP10827 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THRAP10827 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
THRAP10827 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
THRAP10827 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
THRAP10827 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
THRAP10827 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
THRAP10827 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
THRAP10827 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
THRAP10827 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
THRAP10827 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
THRAP10827 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
THRAP10827 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
THRAP10827 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
THRAP10827 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THRAP10827 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THRAP10827 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THRAP10827 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THRAP10827 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THRAP10827 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THRAP10827 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THRAP10827 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THRAP10827 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
THRAP10827 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THRAP10827 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THRAP10827 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THRAP10827 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THRAP10827 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
THRAP10827 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
THRAP10827 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THRAP10827 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THRAP10827 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
THRAP10827 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THRAP10827 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
THRAP10827 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
THRAP10827 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THRAP10827 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
THRAP10827 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
THRAP10827 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THRAP10827 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
THRAP10827 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THRAP10827 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms