Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR2F1P10589 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR2F1P10589 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR2F1P10589 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR2F1P10589 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR2F1P10589 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR2F1P10589 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR2F1P10589 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR2F1P10589 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR2F1P10589 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR2F1P10589 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR2F1P10589 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR2F1P10589 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR2F1P10589 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR2F1P10589 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR2F1P10589 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR2F1P10589 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR2F1P10589 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR2F1P10589 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR2F1P10589 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR2F1P10589 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR2F1P10589 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR2F1P10589 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR2F1P10589 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR2F1P10589 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR2F1P10589 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR2F1P10589 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR2F1P10589 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR2F1P10589 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR2F1P10589 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR2F1P10589 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR2F1P10589 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR2F1P10589 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR2F1P10589 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR2F1P10589 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR2F1P10589 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR2F1P10589 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR2F1P10589 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR2F1P10589 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR2F1P10589 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR2F1P10589 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR2F1P10589 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR2F1P10589 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NR2F1P10589 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR2F1P10589 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR2F1P10589 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NR2F1P10589 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR2F1P10589 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR2F1P10589 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR2F1P10589 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR2F1P10589 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR2F1P10589 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR2F1P10589 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR2F1P10589 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NR2F1P10589 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR2F1P10589 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR2F1P10589 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR2F1P10589 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR2F1P10589 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NR2F1P10589 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR2F1P10589 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR2F1P10589 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR2F1P10589 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR2F1P10589 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR2F1P10589 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR2F1P10589 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR2F1P10589 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR2F1P10589 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR2F1P10589 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR2F1P10589 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR2F1P10589 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR2F1P10589 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NR2F1P10589 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR2F1P10589 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR2F1P10589 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR2F1P10589 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR2F1P10589 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR2F1P10589 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR2F1P10589 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR2F1P10589 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR2F1P10589 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR2F1P10589 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR2F1P10589 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR2F1P10589 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NR2F1P10589 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR2F1P10589 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR2F1P10589 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR2F1P10589 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NR2F1P10589 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NR2F1P10589 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NR2F1P10589 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NR2F1P10589 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NR2F1P10589 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NR2F1P10589 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NR2F1P10589 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NR2F1P10589 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NR2F1P10589 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR2F1P10589 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR2F1P10589 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR2F1P10589 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.3 ms