Protein–RNA interactions for Protein: P0DKX4

SMIM18, Small integral membrane protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM18P0DKX4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM18P0DKX4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM18P0DKX4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM18P0DKX4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM18P0DKX4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM18P0DKX4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM18P0DKX4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM18P0DKX4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM18P0DKX4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM18P0DKX4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM18P0DKX4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM18P0DKX4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM18P0DKX4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM18P0DKX4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM18P0DKX4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM18P0DKX4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM18P0DKX4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM18P0DKX4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM18P0DKX4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM18P0DKX4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM18P0DKX4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM18P0DKX4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM18P0DKX4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM18P0DKX4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM18P0DKX4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM18P0DKX4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM18P0DKX4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM18P0DKX4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM18P0DKX4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM18P0DKX4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM18P0DKX4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM18P0DKX4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM18P0DKX4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM18P0DKX4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM18P0DKX4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM18P0DKX4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM18P0DKX4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM18P0DKX4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM18P0DKX4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM18P0DKX4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM18P0DKX4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM18P0DKX4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM18P0DKX4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM18P0DKX4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM18P0DKX4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMIM18P0DKX4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SMIM18P0DKX4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SMIM18P0DKX4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM18P0DKX4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM18P0DKX4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM18P0DKX4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM18P0DKX4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM18P0DKX4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM18P0DKX4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM18P0DKX4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM18P0DKX4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM18P0DKX4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM18P0DKX4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM18P0DKX4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM18P0DKX4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM18P0DKX4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM18P0DKX4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM18P0DKX4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM18P0DKX4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM18P0DKX4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM18P0DKX4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM18P0DKX4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM18P0DKX4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM18P0DKX4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM18P0DKX4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM18P0DKX4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM18P0DKX4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM18P0DKX4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM18P0DKX4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM18P0DKX4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMIM18P0DKX4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMIM18P0DKX4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMIM18P0DKX4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMIM18P0DKX4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMIM18P0DKX4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM18P0DKX4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM18P0DKX4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM18P0DKX4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM18P0DKX4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM18P0DKX4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM18P0DKX4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM18P0DKX4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM18P0DKX4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM18P0DKX4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM18P0DKX4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM18P0DKX4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM18P0DKX4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM18P0DKX4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM18P0DKX4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM18P0DKX4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM18P0DKX4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM18P0DKX4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM18P0DKX4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM18P0DKX4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms