Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC2BP0DI82 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC2BP0DI82 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC2BP0DI82 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC2BP0DI82 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC2BP0DI82 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC2BP0DI82 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC2BP0DI82 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC2BP0DI82 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC2BP0DI82 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC2BP0DI82 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC2BP0DI82 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC2BP0DI82 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC2BP0DI82 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC2BP0DI82 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC2BP0DI82 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC2BP0DI82 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC2BP0DI82 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC2BP0DI82 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC2BP0DI82 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC2BP0DI82 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC2BP0DI82 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC2BP0DI82 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAPPC2BP0DI82 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC2BP0DI82 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC2BP0DI82 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC2BP0DI82 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC2BP0DI82 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC2BP0DI82 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC2BP0DI82 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC2BP0DI82 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC2BP0DI82 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC2BP0DI82 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC2BP0DI82 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC2BP0DI82 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC2BP0DI82 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC2BP0DI82 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC2BP0DI82 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC2BP0DI82 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC2BP0DI82 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC2BP0DI82 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC2BP0DI82 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC2BP0DI82 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC2BP0DI82 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC2BP0DI82 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC2BP0DI82 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC2BP0DI82 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC2BP0DI82 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC2BP0DI82 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC2BP0DI82 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC2BP0DI82 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC2BP0DI82 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC2BP0DI82 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC2BP0DI82 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRAPPC2BP0DI82 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC2BP0DI82 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC2BP0DI82 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC2BP0DI82 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC2BP0DI82 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms