Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC175P0C221 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC175P0C221 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC175P0C221 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC175P0C221 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC175P0C221 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC175P0C221 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC175P0C221 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC175P0C221 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC175P0C221 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC175P0C221 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC175P0C221 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC175P0C221 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC175P0C221 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC175P0C221 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC175P0C221 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC175P0C221 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC175P0C221 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC175P0C221 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC175P0C221 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC175P0C221 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC175P0C221 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC175P0C221 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC175P0C221 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC175P0C221 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC175P0C221 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC175P0C221 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC175P0C221 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC175P0C221 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC175P0C221 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC175P0C221 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC175P0C221 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC175P0C221 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC175P0C221 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC175P0C221 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC175P0C221 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC175P0C221 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC175P0C221 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC175P0C221 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC175P0C221 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC175P0C221 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC175P0C221 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC175P0C221 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC175P0C221 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC175P0C221 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC175P0C221 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC175P0C221 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC175P0C221 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC175P0C221 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC175P0C221 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC175P0C221 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC175P0C221 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC175P0C221 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC175P0C221 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC175P0C221 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC175P0C221 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC175P0C221 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC175P0C221 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC175P0C221 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC175P0C221 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC175P0C221 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC175P0C221 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC175P0C221 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC175P0C221 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC175P0C221 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC175P0C221 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC175P0C221 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC175P0C221 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC175P0C221 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC175P0C221 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC175P0C221 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC175P0C221 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC175P0C221 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC175P0C221 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC175P0C221 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC175P0C221 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC175P0C221 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC175P0C221 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC175P0C221 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC175P0C221 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC175P0C221 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC175P0C221 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC175P0C221 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC175P0C221 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC175P0C221 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC175P0C221 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC175P0C221 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC175P0C221 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC175P0C221 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC175P0C221 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC175P0C221 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC175P0C221 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC175P0C221 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC175P0C221 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC175P0C221 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC175P0C221 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC175P0C221 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC175P0C221 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC175P0C221 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC175P0C221 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms