Protein–RNA interactions for Protein: P09017

HOXC4, Homeobox protein Hox-C4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC4P09017 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXC4P09017 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXC4P09017 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXC4P09017 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXC4P09017 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXC4P09017 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC4P09017 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC4P09017 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC4P09017 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC4P09017 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC4P09017 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC4P09017 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXC4P09017 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXC4P09017 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXC4P09017 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC4P09017 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC4P09017 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC4P09017 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC4P09017 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC4P09017 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC4P09017 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC4P09017 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC4P09017 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXC4P09017 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXC4P09017 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXC4P09017 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC4P09017 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC4P09017 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC4P09017 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC4P09017 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC4P09017 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC4P09017 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC4P09017 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOXC4P09017 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC4P09017 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC4P09017 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC4P09017 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC4P09017 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC4P09017 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC4P09017 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC4P09017 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC4P09017 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC4P09017 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC4P09017 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXC4P09017 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXC4P09017 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXC4P09017 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXC4P09017 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC4P09017 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC4P09017 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC4P09017 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC4P09017 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC4P09017 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC4P09017 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXC4P09017 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXC4P09017 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXC4P09017 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXC4P09017 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXC4P09017 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXC4P09017 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC4P09017 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC4P09017 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC4P09017 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC4P09017 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC4P09017 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC4P09017 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC4P09017 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC4P09017 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC4P09017 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC4P09017 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC4P09017 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC4P09017 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC4P09017 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC4P09017 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC4P09017 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC4P09017 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC4P09017 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC4P09017 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC4P09017 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC4P09017 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC4P09017 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC4P09017 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC4P09017 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC4P09017 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC4P09017 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC4P09017 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC4P09017 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC4P09017 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC4P09017 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC4P09017 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC4P09017 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC4P09017 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC4P09017 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC4P09017 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC4P09017 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC4P09017 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC4P09017 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC4P09017 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC4P09017 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC4P09017 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms