Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPSAP08865 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPSAP08865 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPSAP08865 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPSAP08865 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPSAP08865 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPSAP08865 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPSAP08865 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPSAP08865 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPSAP08865 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPSAP08865 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPSAP08865 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPSAP08865 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPSAP08865 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPSAP08865 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPSAP08865 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPSAP08865 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPSAP08865 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPSAP08865 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPSAP08865 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPSAP08865 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPSAP08865 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPSAP08865 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPSAP08865 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
RPSAP08865 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPSAP08865 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPSAP08865 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPSAP08865 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPSAP08865 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPSAP08865 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPSAP08865 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPSAP08865 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPSAP08865 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPSAP08865 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPSAP08865 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPSAP08865 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPSAP08865 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPSAP08865 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPSAP08865 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPSAP08865 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPSAP08865 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPSAP08865 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPSAP08865 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPSAP08865 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RPSAP08865 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPSAP08865 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RPSAP08865 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPSAP08865 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPSAP08865 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPSAP08865 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPSAP08865 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPSAP08865 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPSAP08865 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPSAP08865 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPSAP08865 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPSAP08865 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPSAP08865 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPSAP08865 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPSAP08865 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RPSAP08865 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RPSAP08865 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPSAP08865 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RPSAP08865 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPSAP08865 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPSAP08865 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPSAP08865 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPSAP08865 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPSAP08865 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPSAP08865 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPSAP08865 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPSAP08865 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPSAP08865 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPSAP08865 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPSAP08865 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPSAP08865 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPSAP08865 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPSAP08865 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPSAP08865 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPSAP08865 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPSAP08865 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPSAP08865 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPSAP08865 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPSAP08865 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPSAP08865 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RPSAP08865 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPSAP08865 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPSAP08865 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
RPSAP08865 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPSAP08865 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPSAP08865 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPSAP08865 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPSAP08865 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPSAP08865 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPSAP08865 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPSAP08865 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPSAP08865 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPSAP08865 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPSAP08865 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPSAP08865 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPSAP08865 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms