Protein–RNA interactions for Protein: P08579

SNRPB2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPB2P08579 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPB2P08579 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPB2P08579 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPB2P08579 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPB2P08579 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRPB2P08579 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRPB2P08579 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRPB2P08579 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRPB2P08579 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRPB2P08579 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRPB2P08579 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRPB2P08579 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNRPB2P08579 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRPB2P08579 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRPB2P08579 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRPB2P08579 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRPB2P08579 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRPB2P08579 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRPB2P08579 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRPB2P08579 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRPB2P08579 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRPB2P08579 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRPB2P08579 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRPB2P08579 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRPB2P08579 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRPB2P08579 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRPB2P08579 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRPB2P08579 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRPB2P08579 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRPB2P08579 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRPB2P08579 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRPB2P08579 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRPB2P08579 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRPB2P08579 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPB2P08579 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPB2P08579 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPB2P08579 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPB2P08579 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPB2P08579 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPB2P08579 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPB2P08579 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPB2P08579 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPB2P08579 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPB2P08579 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPB2P08579 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPB2P08579 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPB2P08579 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRPB2P08579 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRPB2P08579 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRPB2P08579 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRPB2P08579 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRPB2P08579 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRPB2P08579 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRPB2P08579 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRPB2P08579 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRPB2P08579 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRPB2P08579 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRPB2P08579 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRPB2P08579 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRPB2P08579 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRPB2P08579 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRPB2P08579 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRPB2P08579 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRPB2P08579 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRPB2P08579 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPB2P08579 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPB2P08579 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPB2P08579 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPB2P08579 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPB2P08579 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPB2P08579 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPB2P08579 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPB2P08579 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SNRPB2P08579 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNRPB2P08579 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNRPB2P08579 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRPB2P08579 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRPB2P08579 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRPB2P08579 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRPB2P08579 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRPB2P08579 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRPB2P08579 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRPB2P08579 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRPB2P08579 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRPB2P08579 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRPB2P08579 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRPB2P08579 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRPB2P08579 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRPB2P08579 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRPB2P08579 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRPB2P08579 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRPB2P08579 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRPB2P08579 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRPB2P08579 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRPB2P08579 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRPB2P08579 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRPB2P08579 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRPB2P08579 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPB2P08579 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPB2P08579 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms