Protein–RNA interactions for Protein: P08172

CHRM2, Muscarinic acetylcholine receptor M2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM2P08172 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRM2P08172 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRM2P08172 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRM2P08172 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRM2P08172 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRM2P08172 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRM2P08172 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRM2P08172 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRM2P08172 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRM2P08172 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRM2P08172 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRM2P08172 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRM2P08172 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRM2P08172 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRM2P08172 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRM2P08172 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRM2P08172 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRM2P08172 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRM2P08172 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRM2P08172 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRM2P08172 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRM2P08172 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRM2P08172 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRM2P08172 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRM2P08172 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRM2P08172 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRM2P08172 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRM2P08172 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRM2P08172 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHRM2P08172 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRM2P08172 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRM2P08172 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRM2P08172 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRM2P08172 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRM2P08172 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRM2P08172 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRM2P08172 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRM2P08172 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRM2P08172 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRM2P08172 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRM2P08172 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRM2P08172 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRM2P08172 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRM2P08172 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRM2P08172 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRM2P08172 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRM2P08172 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRM2P08172 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRM2P08172 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRM2P08172 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRM2P08172 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRM2P08172 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRM2P08172 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRM2P08172 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRM2P08172 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRM2P08172 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRM2P08172 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRM2P08172 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRM2P08172 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRM2P08172 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRM2P08172 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRM2P08172 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRM2P08172 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRM2P08172 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRM2P08172 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRM2P08172 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRM2P08172 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRM2P08172 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRM2P08172 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRM2P08172 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRM2P08172 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRM2P08172 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRM2P08172 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRM2P08172 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRM2P08172 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRM2P08172 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRM2P08172 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRM2P08172 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRM2P08172 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRM2P08172 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRM2P08172 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRM2P08172 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRM2P08172 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRM2P08172 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRM2P08172 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRM2P08172 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRM2P08172 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRM2P08172 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRM2P08172 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRM2P08172 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRM2P08172 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRM2P08172 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRM2P08172 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRM2P08172 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRM2P08172 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRM2P08172 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRM2P08172 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRM2P08172 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRM2P08172 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRM2P08172 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms