Protein–RNA interactions for Protein: P06730

EIF4E, Eukaryotic translation initiation factor 4E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EP06730 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4EP06730 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4EP06730 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF4EP06730 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF4EP06730 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF4EP06730 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF4EP06730 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF4EP06730 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF4EP06730 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF4EP06730 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF4EP06730 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF4EP06730 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF4EP06730 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF4EP06730 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF4EP06730 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF4EP06730 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF4EP06730 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF4EP06730 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF4EP06730 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF4EP06730 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF4EP06730 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF4EP06730 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF4EP06730 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF4EP06730 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF4EP06730 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF4EP06730 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF4EP06730 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF4EP06730 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF4EP06730 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF4EP06730 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF4EP06730 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF4EP06730 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF4EP06730 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF4EP06730 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EIF4EP06730 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EIF4EP06730 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF4EP06730 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF4EP06730 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF4EP06730 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF4EP06730 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF4EP06730 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF4EP06730 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF4EP06730 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF4EP06730 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF4EP06730 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF4EP06730 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF4EP06730 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF4EP06730 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF4EP06730 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF4EP06730 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF4EP06730 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF4EP06730 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF4EP06730 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF4EP06730 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF4EP06730 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF4EP06730 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF4EP06730 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF4EP06730 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF4EP06730 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF4EP06730 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF4EP06730 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF4EP06730 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF4EP06730 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF4EP06730 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF4EP06730 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF4EP06730 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF4EP06730 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF4EP06730 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF4EP06730 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
EIF4EP06730 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF4EP06730 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF4EP06730 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF4EP06730 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF4EP06730 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF4EP06730 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF4EP06730 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF4EP06730 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF4EP06730 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF4EP06730 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF4EP06730 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF4EP06730 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF4EP06730 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF4EP06730 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF4EP06730 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF4EP06730 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF4EP06730 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF4EP06730 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF4EP06730 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF4EP06730 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF4EP06730 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF4EP06730 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF4EP06730 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF4EP06730 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF4EP06730 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF4EP06730 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF4EP06730 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF4EP06730 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF4EP06730 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF4EP06730 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF4EP06730 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms