Protein–RNA interactions for Protein: P04278

SHBG, Sex hormone-binding globulin, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBGP04278 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHBGP04278 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHBGP04278 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHBGP04278 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHBGP04278 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHBGP04278 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHBGP04278 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHBGP04278 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHBGP04278 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHBGP04278 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHBGP04278 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHBGP04278 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHBGP04278 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHBGP04278 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHBGP04278 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHBGP04278 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHBGP04278 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHBGP04278 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SHBGP04278 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHBGP04278 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHBGP04278 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHBGP04278 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHBGP04278 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHBGP04278 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHBGP04278 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHBGP04278 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHBGP04278 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHBGP04278 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHBGP04278 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SHBGP04278 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHBGP04278 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHBGP04278 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHBGP04278 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SHBGP04278 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHBGP04278 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHBGP04278 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SHBGP04278 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHBGP04278 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHBGP04278 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHBGP04278 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHBGP04278 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHBGP04278 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHBGP04278 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHBGP04278 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHBGP04278 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHBGP04278 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHBGP04278 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHBGP04278 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHBGP04278 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHBGP04278 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHBGP04278 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHBGP04278 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHBGP04278 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHBGP04278 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHBGP04278 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHBGP04278 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHBGP04278 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHBGP04278 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SHBGP04278 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SHBGP04278 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHBGP04278 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHBGP04278 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHBGP04278 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHBGP04278 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHBGP04278 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHBGP04278 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHBGP04278 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHBGP04278 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHBGP04278 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHBGP04278 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHBGP04278 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHBGP04278 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHBGP04278 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHBGP04278 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHBGP04278 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHBGP04278 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHBGP04278 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHBGP04278 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHBGP04278 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHBGP04278 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHBGP04278 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHBGP04278 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHBGP04278 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHBGP04278 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SHBGP04278 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHBGP04278 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHBGP04278 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SHBGP04278 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SHBGP04278 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SHBGP04278 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SHBGP04278 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHBGP04278 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHBGP04278 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHBGP04278 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHBGP04278 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHBGP04278 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SHBGP04278 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHBGP04278 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHBGP04278 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHBGP04278 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms