Protein–RNA interactions for Protein: P01700

IGLV1-47, Immunoglobulin lambda variable 1-47, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGLV1-47P01700 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGLV1-47P01700 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGLV1-47P01700 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGLV1-47P01700 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGLV1-47P01700 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGLV1-47P01700 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGLV1-47P01700 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGLV1-47P01700 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGLV1-47P01700 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGLV1-47P01700 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGLV1-47P01700 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGLV1-47P01700 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGLV1-47P01700 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGLV1-47P01700 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGLV1-47P01700 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGLV1-47P01700 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGLV1-47P01700 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGLV1-47P01700 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGLV1-47P01700 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGLV1-47P01700 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGLV1-47P01700 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGLV1-47P01700 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGLV1-47P01700 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGLV1-47P01700 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IGLV1-47P01700 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IGLV1-47P01700 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IGLV1-47P01700 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IGLV1-47P01700 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IGLV1-47P01700 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IGLV1-47P01700 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IGLV1-47P01700 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IGLV1-47P01700 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IGLV1-47P01700 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IGLV1-47P01700 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IGLV1-47P01700 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
IGLV1-47P01700 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGLV1-47P01700 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGLV1-47P01700 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGLV1-47P01700 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGLV1-47P01700 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IGLV1-47P01700 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IGLV1-47P01700 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IGLV1-47P01700 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IGLV1-47P01700 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
IGLV1-47P01700 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IGLV1-47P01700 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IGLV1-47P01700 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IGLV1-47P01700 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGLV1-47P01700 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGLV1-47P01700 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGLV1-47P01700 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGLV1-47P01700 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGLV1-47P01700 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGLV1-47P01700 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGLV1-47P01700 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGLV1-47P01700 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGLV1-47P01700 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGLV1-47P01700 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGLV1-47P01700 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGLV1-47P01700 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGLV1-47P01700 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGLV1-47P01700 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGLV1-47P01700 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGLV1-47P01700 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGLV1-47P01700 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGLV1-47P01700 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGLV1-47P01700 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGLV1-47P01700 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGLV1-47P01700 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGLV1-47P01700 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGLV1-47P01700 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
IGLV1-47P01700 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGLV1-47P01700 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGLV1-47P01700 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGLV1-47P01700 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGLV1-47P01700 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGLV1-47P01700 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGLV1-47P01700 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGLV1-47P01700 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGLV1-47P01700 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGLV1-47P01700 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGLV1-47P01700 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGLV1-47P01700 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGLV1-47P01700 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGLV1-47P01700 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGLV1-47P01700 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGLV1-47P01700 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGLV1-47P01700 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGLV1-47P01700 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGLV1-47P01700 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGLV1-47P01700 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGLV1-47P01700 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGLV1-47P01700 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGLV1-47P01700 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGLV1-47P01700 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGLV1-47P01700 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGLV1-47P01700 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IGLV1-47P01700 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGLV1-47P01700 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IGLV1-47P01700 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms