Protein–RNA interactions for Protein: P01011

SERPINA3, Alpha-1-antichymotrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA3P01011 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SERPINA3P01011 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERPINA3P01011 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPINA3P01011 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPINA3P01011 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPINA3P01011 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPINA3P01011 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPINA3P01011 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPINA3P01011 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPINA3P01011 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPINA3P01011 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPINA3P01011 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPINA3P01011 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPINA3P01011 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPINA3P01011 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPINA3P01011 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPINA3P01011 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPINA3P01011 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPINA3P01011 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERPINA3P01011 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERPINA3P01011 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERPINA3P01011 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERPINA3P01011 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERPINA3P01011 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERPINA3P01011 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERPINA3P01011 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPINA3P01011 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPINA3P01011 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPINA3P01011 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPINA3P01011 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SERPINA3P01011 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SERPINA3P01011 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPINA3P01011 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPINA3P01011 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPINA3P01011 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPINA3P01011 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPINA3P01011 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPINA3P01011 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPINA3P01011 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPINA3P01011 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPINA3P01011 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SERPINA3P01011 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SERPINA3P01011 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SERPINA3P01011 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SERPINA3P01011 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPINA3P01011 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPINA3P01011 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPINA3P01011 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPINA3P01011 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPINA3P01011 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPINA3P01011 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPINA3P01011 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SERPINA3P01011 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SERPINA3P01011 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SERPINA3P01011 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPINA3P01011 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPINA3P01011 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPINA3P01011 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPINA3P01011 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPINA3P01011 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SERPINA3P01011 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPINA3P01011 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPINA3P01011 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPINA3P01011 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINA3P01011 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINA3P01011 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINA3P01011 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINA3P01011 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINA3P01011 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINA3P01011 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINA3P01011 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINA3P01011 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINA3P01011 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINA3P01011 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINA3P01011 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINA3P01011 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINA3P01011 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINA3P01011 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINA3P01011 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINA3P01011 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINA3P01011 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINA3P01011 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINA3P01011 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPINA3P01011 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPINA3P01011 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPINA3P01011 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPINA3P01011 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPINA3P01011 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPINA3P01011 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPINA3P01011 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPINA3P01011 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERPINA3P01011 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERPINA3P01011 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERPINA3P01011 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SERPINA3P01011 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SERPINA3P01011 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SERPINA3P01011 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SERPINA3P01011 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPINA3P01011 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPINA3P01011 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms