Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERPINA1P01009 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERPINA1P01009 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERPINA1P01009 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERPINA1P01009 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERPINA1P01009 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERPINA1P01009 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERPINA1P01009 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SERPINA1P01009 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERPINA1P01009 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERPINA1P01009 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERPINA1P01009 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERPINA1P01009 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERPINA1P01009 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERPINA1P01009 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERPINA1P01009 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERPINA1P01009 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERPINA1P01009 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERPINA1P01009 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERPINA1P01009 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SERPINA1P01009 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPINA1P01009 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPINA1P01009 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPINA1P01009 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SERPINA1P01009 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERPINA1P01009 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SERPINA1P01009 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERPINA1P01009 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERPINA1P01009 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SERPINA1P01009 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SERPINA1P01009 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SERPINA1P01009 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SERPINA1P01009 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERPINA1P01009 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERPINA1P01009 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERPINA1P01009 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERPINA1P01009 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERPINA1P01009 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERPINA1P01009 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERPINA1P01009 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERPINA1P01009 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERPINA1P01009 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERPINA1P01009 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERPINA1P01009 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERPINA1P01009 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERPINA1P01009 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERPINA1P01009 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERPINA1P01009 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERPINA1P01009 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERPINA1P01009 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERPINA1P01009 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERPINA1P01009 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPINA1P01009 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPINA1P01009 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPINA1P01009 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPINA1P01009 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPINA1P01009 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPINA1P01009 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPINA1P01009 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERPINA1P01009 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERPINA1P01009 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERPINA1P01009 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERPINA1P01009 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPINA1P01009 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPINA1P01009 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPINA1P01009 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPINA1P01009 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPINA1P01009 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPINA1P01009 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPINA1P01009 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPINA1P01009 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERPINA1P01009 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERPINA1P01009 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERPINA1P01009 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERPINA1P01009 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERPINA1P01009 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERPINA1P01009 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERPINA1P01009 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERPINA1P01009 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERPINA1P01009 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERPINA1P01009 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SERPINA1P01009 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SERPINA1P01009 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SERPINA1P01009 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SERPINA1P01009 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINA1P01009 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINA1P01009 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINA1P01009 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINA1P01009 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINA1P01009 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINA1P01009 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINA1P01009 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERPINA1P01009 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERPINA1P01009 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERPINA1P01009 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERPINA1P01009 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINA1P01009 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINA1P01009 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINA1P01009 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINA1P01009 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.9 ms