Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STAMBPO95630 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STAMBPO95630 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAMBPO95630 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAMBPO95630 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAMBPO95630 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STAMBPO95630 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAMBPO95630 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
STAMBPO95630 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAMBPO95630 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAMBPO95630 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAMBPO95630 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAMBPO95630 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAMBPO95630 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAMBPO95630 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAMBPO95630 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STAMBPO95630 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STAMBPO95630 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
STAMBPO95630 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
STAMBPO95630 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STAMBPO95630 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
STAMBPO95630 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
STAMBPO95630 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STAMBPO95630 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STAMBPO95630 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
STAMBPO95630 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STAMBPO95630 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STAMBPO95630 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STAMBPO95630 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
STAMBPO95630 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STAMBPO95630 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
STAMBPO95630 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STAMBPO95630 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
STAMBPO95630 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STAMBPO95630 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
STAMBPO95630 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STAMBPO95630 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
STAMBPO95630 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STAMBPO95630 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
STAMBPO95630 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
STAMBPO95630 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
STAMBPO95630 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STAMBPO95630 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STAMBPO95630 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
STAMBPO95630 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STAMBPO95630 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
STAMBPO95630 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STAMBPO95630 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STAMBPO95630 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
STAMBPO95630 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STAMBPO95630 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STAMBPO95630 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
STAMBPO95630 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
STAMBPO95630 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
STAMBPO95630 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STAMBPO95630 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
STAMBPO95630 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
STAMBPO95630 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
STAMBPO95630 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
STAMBPO95630 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STAMBPO95630 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
STAMBPO95630 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STAMBPO95630 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
STAMBPO95630 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
STAMBPO95630 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STAMBPO95630 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STAMBPO95630 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STAMBPO95630 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STAMBPO95630 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STAMBPO95630 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STAMBPO95630 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STAMBPO95630 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAMBPO95630 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAMBPO95630 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAMBPO95630 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAMBPO95630 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
STAMBPO95630 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAMBPO95630 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAMBPO95630 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAMBPO95630 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STAMBPO95630 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STAMBPO95630 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STAMBPO95630 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STAMBPO95630 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STAMBPO95630 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STAMBPO95630 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STAMBPO95630 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STAMBPO95630 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STAMBPO95630 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STAMBPO95630 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STAMBPO95630 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STAMBPO95630 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STAMBPO95630 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STAMBPO95630 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STAMBPO95630 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STAMBPO95630 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STAMBPO95630 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STAMBPO95630 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STAMBPO95630 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
STAMBPO95630 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms