Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CLSTN1O94985 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLSTN1O94985 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CLSTN1O94985 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLSTN1O94985 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLSTN1O94985 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLSTN1O94985 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CLSTN1O94985 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLSTN1O94985 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLSTN1O94985 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLSTN1O94985 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLSTN1O94985 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CLSTN1O94985 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLSTN1O94985 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLSTN1O94985 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLSTN1O94985 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLSTN1O94985 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLSTN1O94985 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLSTN1O94985 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLSTN1O94985 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLSTN1O94985 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLSTN1O94985 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLSTN1O94985 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLSTN1O94985 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLSTN1O94985 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLSTN1O94985 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLSTN1O94985 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLSTN1O94985 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLSTN1O94985 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLSTN1O94985 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLSTN1O94985 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLSTN1O94985 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CLSTN1O94985 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLSTN1O94985 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLSTN1O94985 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLSTN1O94985 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLSTN1O94985 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLSTN1O94985 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLSTN1O94985 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLSTN1O94985 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLSTN1O94985 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLSTN1O94985 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLSTN1O94985 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLSTN1O94985 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLSTN1O94985 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLSTN1O94985 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLSTN1O94985 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLSTN1O94985 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLSTN1O94985 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLSTN1O94985 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLSTN1O94985 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLSTN1O94985 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLSTN1O94985 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLSTN1O94985 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLSTN1O94985 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLSTN1O94985 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLSTN1O94985 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLSTN1O94985 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLSTN1O94985 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLSTN1O94985 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLSTN1O94985 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLSTN1O94985 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLSTN1O94985 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLSTN1O94985 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLSTN1O94985 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLSTN1O94985 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLSTN1O94985 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLSTN1O94985 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLSTN1O94985 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLSTN1O94985 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLSTN1O94985 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLSTN1O94985 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLSTN1O94985 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLSTN1O94985 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLSTN1O94985 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSTN1O94985 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSTN1O94985 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSTN1O94985 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSTN1O94985 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSTN1O94985 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSTN1O94985 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLSTN1O94985 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLSTN1O94985 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLSTN1O94985 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLSTN1O94985 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLSTN1O94985 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLSTN1O94985 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLSTN1O94985 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLSTN1O94985 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLSTN1O94985 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLSTN1O94985 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLSTN1O94985 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLSTN1O94985 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLSTN1O94985 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLSTN1O94985 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLSTN1O94985 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLSTN1O94985 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLSTN1O94985 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLSTN1O94985 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CLSTN1O94985 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms