Protein–RNA interactions for Protein: O94964

SOGA1, Protein SOGA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA1O94964 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
SOGA1O94964 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
SOGA1O94964 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.74■■■■■ 4.43
SOGA1O94964 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
SOGA1O94964 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
SOGA1O94964 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
SOGA1O94964 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC42.73■■■■■ 4.43
SOGA1O94964 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC42.72■■■■■ 4.43
SOGA1O94964 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
SOGA1O94964 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
SOGA1O94964 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.71■■■■■ 4.43
SOGA1O94964 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
SOGA1O94964 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
SOGA1O94964 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
SOGA1O94964 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC42.7■■■■■ 4.43
SOGA1O94964 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC42.7■■■■■ 4.43
SOGA1O94964 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
SOGA1O94964 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
SOGA1O94964 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
SOGA1O94964 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
SOGA1O94964 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC42.69■■■■■ 4.42
SOGA1O94964 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
SOGA1O94964 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC42.68■■■■■ 4.42
SOGA1O94964 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
SOGA1O94964 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
SOGA1O94964 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC42.67■■■■■ 4.42
SOGA1O94964 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
SOGA1O94964 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
SOGA1O94964 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC42.66■■■■■ 4.42
SOGA1O94964 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.66■■■■■ 4.42
SOGA1O94964 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC42.65■■■■■ 4.42
SOGA1O94964 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC42.65■■■■■ 4.42
SOGA1O94964 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
SOGA1O94964 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
SOGA1O94964 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
SOGA1O94964 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
SOGA1O94964 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
SOGA1O94964 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC42.61■■■■■ 4.41
SOGA1O94964 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC42.6■■■■■ 4.41
SOGA1O94964 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC42.6■■■■■ 4.41
SOGA1O94964 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
SOGA1O94964 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC42.59■■■■■ 4.41
SOGA1O94964 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.59■■■■■ 4.41
SOGA1O94964 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC42.59■■■■■ 4.41
SOGA1O94964 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.57■■■■■ 4.41
SOGA1O94964 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
SOGA1O94964 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
SOGA1O94964 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC42.57■■■■■ 4.41
SOGA1O94964 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
SOGA1O94964 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC42.56■■■■■ 4.4
SOGA1O94964 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
SOGA1O94964 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
SOGA1O94964 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC42.55■■■■■ 4.4
SOGA1O94964 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
SOGA1O94964 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
SOGA1O94964 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
SOGA1O94964 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
SOGA1O94964 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
SOGA1O94964 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC42.54■■■■■ 4.4
SOGA1O94964 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
SOGA1O94964 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
SOGA1O94964 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.53■■■■■ 4.4
SOGA1O94964 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC42.53■■■■■ 4.4
SOGA1O94964 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
SOGA1O94964 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
SOGA1O94964 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC42.52■■■■■ 4.4
SOGA1O94964 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
SOGA1O94964 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
SOGA1O94964 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
SOGA1O94964 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
SOGA1O94964 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
SOGA1O94964 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
SOGA1O94964 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
SOGA1O94964 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.49■■■■■ 4.39
SOGA1O94964 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
SOGA1O94964 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
SOGA1O94964 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
SOGA1O94964 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
SOGA1O94964 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
SOGA1O94964 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC42.48■■■■■ 4.39
SOGA1O94964 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
SOGA1O94964 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
SOGA1O94964 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
SOGA1O94964 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.47■■■■■ 4.39
SOGA1O94964 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC42.47■■■■■ 4.39
SOGA1O94964 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC42.47■■■■■ 4.39
SOGA1O94964 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
SOGA1O94964 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
SOGA1O94964 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
SOGA1O94964 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC42.46■■■■■ 4.39
SOGA1O94964 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
SOGA1O94964 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
SOGA1O94964 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
SOGA1O94964 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC42.44■■■■■ 4.38
SOGA1O94964 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
SOGA1O94964 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC42.43■■■■■ 4.38
SOGA1O94964 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
SOGA1O94964 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
SOGA1O94964 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
SOGA1O94964 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms