Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNKO75909 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNKO75909 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNKO75909 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNKO75909 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNKO75909 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNKO75909 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNKO75909 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNKO75909 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNKO75909 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNKO75909 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNKO75909 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNKO75909 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNKO75909 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNKO75909 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNKO75909 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNKO75909 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNKO75909 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNKO75909 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNKO75909 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNKO75909 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNKO75909 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNKO75909 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNKO75909 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNKO75909 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCNKO75909 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCNKO75909 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNKO75909 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNKO75909 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNKO75909 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNKO75909 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNKO75909 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNKO75909 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNKO75909 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNKO75909 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNKO75909 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNKO75909 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNKO75909 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNKO75909 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNKO75909 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNKO75909 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNKO75909 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNKO75909 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNKO75909 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNKO75909 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNKO75909 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNKO75909 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNKO75909 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNKO75909 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNKO75909 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNKO75909 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNKO75909 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNKO75909 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNKO75909 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNKO75909 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNKO75909 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNKO75909 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNKO75909 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNKO75909 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNKO75909 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNKO75909 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNKO75909 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNKO75909 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNKO75909 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNKO75909 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNKO75909 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNKO75909 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNKO75909 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNKO75909 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNKO75909 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNKO75909 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNKO75909 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNKO75909 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNKO75909 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNKO75909 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNKO75909 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNKO75909 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNKO75909 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNKO75909 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNKO75909 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNKO75909 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNKO75909 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNKO75909 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNKO75909 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNKO75909 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNKO75909 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNKO75909 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNKO75909 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNKO75909 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNKO75909 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNKO75909 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCNKO75909 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNKO75909 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNKO75909 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNKO75909 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNKO75909 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNKO75909 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNKO75909 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNKO75909 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNKO75909 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms