Protein–RNA interactions for Protein: O75074

LRP3, Low-density lipoprotein receptor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3O75074 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRP3O75074 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRP3O75074 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRP3O75074 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRP3O75074 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRP3O75074 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRP3O75074 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRP3O75074 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRP3O75074 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRP3O75074 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRP3O75074 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRP3O75074 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRP3O75074 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRP3O75074 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRP3O75074 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRP3O75074 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRP3O75074 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRP3O75074 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LRP3O75074 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRP3O75074 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRP3O75074 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRP3O75074 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRP3O75074 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRP3O75074 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRP3O75074 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRP3O75074 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRP3O75074 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRP3O75074 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRP3O75074 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRP3O75074 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRP3O75074 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRP3O75074 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRP3O75074 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRP3O75074 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRP3O75074 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRP3O75074 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRP3O75074 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRP3O75074 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP3O75074 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP3O75074 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP3O75074 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP3O75074 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP3O75074 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP3O75074 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP3O75074 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP3O75074 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP3O75074 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP3O75074 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRP3O75074 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRP3O75074 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRP3O75074 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LRP3O75074 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRP3O75074 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRP3O75074 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRP3O75074 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRP3O75074 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRP3O75074 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRP3O75074 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRP3O75074 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRP3O75074 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRP3O75074 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRP3O75074 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRP3O75074 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRP3O75074 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRP3O75074 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRP3O75074 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRP3O75074 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRP3O75074 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRP3O75074 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRP3O75074 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRP3O75074 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRP3O75074 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LRP3O75074 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRP3O75074 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRP3O75074 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRP3O75074 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRP3O75074 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRP3O75074 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRP3O75074 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LRP3O75074 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRP3O75074 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRP3O75074 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRP3O75074 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRP3O75074 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRP3O75074 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRP3O75074 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LRP3O75074 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRP3O75074 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRP3O75074 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRP3O75074 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRP3O75074 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRP3O75074 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRP3O75074 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRP3O75074 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRP3O75074 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRP3O75074 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRP3O75074 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRP3O75074 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRP3O75074 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRP3O75074 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms