Protein–RNA interactions for Protein: O60568

PLOD3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD3O60568 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLOD3O60568 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLOD3O60568 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLOD3O60568 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLOD3O60568 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLOD3O60568 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLOD3O60568 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLOD3O60568 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLOD3O60568 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLOD3O60568 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLOD3O60568 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLOD3O60568 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLOD3O60568 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLOD3O60568 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLOD3O60568 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLOD3O60568 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLOD3O60568 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLOD3O60568 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLOD3O60568 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLOD3O60568 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLOD3O60568 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLOD3O60568 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLOD3O60568 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLOD3O60568 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLOD3O60568 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PLOD3O60568 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLOD3O60568 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLOD3O60568 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLOD3O60568 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLOD3O60568 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PLOD3O60568 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PLOD3O60568 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLOD3O60568 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLOD3O60568 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLOD3O60568 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLOD3O60568 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLOD3O60568 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLOD3O60568 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLOD3O60568 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLOD3O60568 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLOD3O60568 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLOD3O60568 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLOD3O60568 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLOD3O60568 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLOD3O60568 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLOD3O60568 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PLOD3O60568 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLOD3O60568 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLOD3O60568 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLOD3O60568 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLOD3O60568 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLOD3O60568 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLOD3O60568 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PLOD3O60568 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLOD3O60568 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLOD3O60568 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLOD3O60568 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLOD3O60568 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLOD3O60568 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLOD3O60568 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLOD3O60568 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLOD3O60568 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLOD3O60568 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLOD3O60568 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLOD3O60568 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLOD3O60568 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLOD3O60568 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLOD3O60568 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLOD3O60568 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLOD3O60568 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PLOD3O60568 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLOD3O60568 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLOD3O60568 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLOD3O60568 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLOD3O60568 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLOD3O60568 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLOD3O60568 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLOD3O60568 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLOD3O60568 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLOD3O60568 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLOD3O60568 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLOD3O60568 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PLOD3O60568 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLOD3O60568 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLOD3O60568 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLOD3O60568 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLOD3O60568 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLOD3O60568 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLOD3O60568 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLOD3O60568 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLOD3O60568 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLOD3O60568 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLOD3O60568 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLOD3O60568 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLOD3O60568 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLOD3O60568 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLOD3O60568 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLOD3O60568 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLOD3O60568 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLOD3O60568 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms