Protein–RNA interactions for Protein: O60383

GDF9, Growth/differentiation factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF9O60383 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF9O60383 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF9O60383 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF9O60383 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF9O60383 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF9O60383 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF9O60383 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF9O60383 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF9O60383 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDF9O60383 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDF9O60383 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDF9O60383 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDF9O60383 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GDF9O60383 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDF9O60383 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDF9O60383 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF9O60383 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF9O60383 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF9O60383 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF9O60383 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF9O60383 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF9O60383 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF9O60383 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF9O60383 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF9O60383 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF9O60383 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF9O60383 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF9O60383 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF9O60383 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF9O60383 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF9O60383 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF9O60383 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF9O60383 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF9O60383 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF9O60383 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF9O60383 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF9O60383 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDF9O60383 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDF9O60383 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDF9O60383 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDF9O60383 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDF9O60383 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDF9O60383 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDF9O60383 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDF9O60383 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDF9O60383 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDF9O60383 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDF9O60383 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDF9O60383 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDF9O60383 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GDF9O60383 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDF9O60383 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF9O60383 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF9O60383 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF9O60383 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF9O60383 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF9O60383 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF9O60383 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF9O60383 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF9O60383 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF9O60383 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF9O60383 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF9O60383 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF9O60383 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF9O60383 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF9O60383 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF9O60383 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF9O60383 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF9O60383 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF9O60383 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDF9O60383 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDF9O60383 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDF9O60383 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDF9O60383 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GDF9O60383 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDF9O60383 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDF9O60383 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GDF9O60383 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
GDF9O60383 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDF9O60383 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDF9O60383 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF9O60383 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF9O60383 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF9O60383 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF9O60383 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF9O60383 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF9O60383 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF9O60383 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF9O60383 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF9O60383 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF9O60383 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF9O60383 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF9O60383 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF9O60383 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF9O60383 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF9O60383 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF9O60383 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF9O60383 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF9O60383 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF9O60383 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms