Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
ATP10AO60312 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
ATP10AO60312 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
ATP10AO60312 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.06■■■■□ 3.68
ATP10AO60312 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
ATP10AO60312 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
ATP10AO60312 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
ATP10AO60312 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
ATP10AO60312 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
ATP10AO60312 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
ATP10AO60312 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
ATP10AO60312 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
ATP10AO60312 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
ATP10AO60312 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
ATP10AO60312 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
ATP10AO60312 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
ATP10AO60312 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
ATP10AO60312 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
ATP10AO60312 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
ATP10AO60312 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
ATP10AO60312 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
ATP10AO60312 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
ATP10AO60312 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
ATP10AO60312 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
ATP10AO60312 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
ATP10AO60312 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
ATP10AO60312 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
ATP10AO60312 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
ATP10AO60312 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
ATP10AO60312 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
ATP10AO60312 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
ATP10AO60312 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
ATP10AO60312 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.98■■■■□ 3.67
ATP10AO60312 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
ATP10AO60312 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
ATP10AO60312 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
ATP10AO60312 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
ATP10AO60312 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
ATP10AO60312 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
ATP10AO60312 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
ATP10AO60312 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
ATP10AO60312 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
ATP10AO60312 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
ATP10AO60312 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
ATP10AO60312 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
ATP10AO60312 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
ATP10AO60312 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
ATP10AO60312 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
ATP10AO60312 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
ATP10AO60312 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
ATP10AO60312 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
ATP10AO60312 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
ATP10AO60312 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
ATP10AO60312 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
ATP10AO60312 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
ATP10AO60312 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
ATP10AO60312 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
ATP10AO60312 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
ATP10AO60312 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
ATP10AO60312 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
ATP10AO60312 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
ATP10AO60312 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
ATP10AO60312 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC37.88■■■■□ 3.66
ATP10AO60312 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
ATP10AO60312 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
ATP10AO60312 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
ATP10AO60312 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
ATP10AO60312 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
ATP10AO60312 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
ATP10AO60312 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
ATP10AO60312 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
ATP10AO60312 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
ATP10AO60312 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
ATP10AO60312 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
ATP10AO60312 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
ATP10AO60312 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
ATP10AO60312 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
ATP10AO60312 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
ATP10AO60312 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
ATP10AO60312 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
ATP10AO60312 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
ATP10AO60312 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
ATP10AO60312 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
ATP10AO60312 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
ATP10AO60312 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
ATP10AO60312 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC37.81■■■■□ 3.64
ATP10AO60312 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
ATP10AO60312 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
ATP10AO60312 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC37.81■■■■□ 3.64
ATP10AO60312 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
ATP10AO60312 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
ATP10AO60312 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
ATP10AO60312 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
ATP10AO60312 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
ATP10AO60312 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
ATP10AO60312 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
ATP10AO60312 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
ATP10AO60312 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
ATP10AO60312 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC37.77■■■■□ 3.64
ATP10AO60312 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms