Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEP104O60308 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEP104O60308 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEP104O60308 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CEP104O60308 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP104O60308 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP104O60308 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP104O60308 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP104O60308 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP104O60308 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP104O60308 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP104O60308 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP104O60308 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP104O60308 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP104O60308 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP104O60308 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP104O60308 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP104O60308 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP104O60308 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP104O60308 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP104O60308 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP104O60308 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP104O60308 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP104O60308 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP104O60308 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP104O60308 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP104O60308 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP104O60308 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CEP104O60308 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CEP104O60308 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CEP104O60308 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CEP104O60308 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP104O60308 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP104O60308 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP104O60308 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP104O60308 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP104O60308 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP104O60308 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP104O60308 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP104O60308 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP104O60308 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP104O60308 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP104O60308 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP104O60308 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP104O60308 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP104O60308 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP104O60308 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP104O60308 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP104O60308 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP104O60308 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP104O60308 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP104O60308 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP104O60308 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP104O60308 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP104O60308 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP104O60308 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP104O60308 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP104O60308 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CEP104O60308 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CEP104O60308 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP104O60308 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP104O60308 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP104O60308 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP104O60308 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP104O60308 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP104O60308 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CEP104O60308 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CEP104O60308 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CEP104O60308 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CEP104O60308 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CEP104O60308 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CEP104O60308 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CEP104O60308 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP104O60308 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP104O60308 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP104O60308 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CEP104O60308 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CEP104O60308 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CEP104O60308 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CEP104O60308 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CEP104O60308 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CEP104O60308 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CEP104O60308 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CEP104O60308 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CEP104O60308 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CEP104O60308 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP104O60308 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP104O60308 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP104O60308 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP104O60308 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP104O60308 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP104O60308 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP104O60308 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP104O60308 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP104O60308 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP104O60308 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP104O60308 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP104O60308 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP104O60308 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP104O60308 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms