Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGR2O43760 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGR2O43760 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGR2O43760 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGR2O43760 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGR2O43760 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNGR2O43760 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNGR2O43760 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGR2O43760 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGR2O43760 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGR2O43760 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGR2O43760 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGR2O43760 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGR2O43760 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGR2O43760 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGR2O43760 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGR2O43760 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNGR2O43760 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNGR2O43760 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNGR2O43760 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNGR2O43760 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNGR2O43760 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNGR2O43760 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNGR2O43760 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNGR2O43760 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNGR2O43760 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNGR2O43760 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNGR2O43760 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNGR2O43760 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNGR2O43760 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYNGR2O43760 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYNGR2O43760 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYNGR2O43760 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNGR2O43760 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNGR2O43760 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNGR2O43760 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNGR2O43760 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNGR2O43760 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNGR2O43760 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNGR2O43760 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNGR2O43760 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms