Protein–RNA interactions for Protein: O43736

ITM2A, Integral membrane protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2AO43736 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITM2AO43736 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITM2AO43736 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITM2AO43736 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITM2AO43736 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITM2AO43736 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ITM2AO43736 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITM2AO43736 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITM2AO43736 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITM2AO43736 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ITM2AO43736 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITM2AO43736 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITM2AO43736 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ITM2AO43736 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITM2AO43736 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITM2AO43736 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITM2AO43736 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITM2AO43736 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITM2AO43736 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITM2AO43736 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITM2AO43736 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ITM2AO43736 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITM2AO43736 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITM2AO43736 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITM2AO43736 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITM2AO43736 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITM2AO43736 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITM2AO43736 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITM2AO43736 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITM2AO43736 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITM2AO43736 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITM2AO43736 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITM2AO43736 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITM2AO43736 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITM2AO43736 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITM2AO43736 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITM2AO43736 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ITM2AO43736 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITM2AO43736 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITM2AO43736 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITM2AO43736 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITM2AO43736 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ITM2AO43736 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITM2AO43736 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITM2AO43736 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITM2AO43736 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITM2AO43736 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITM2AO43736 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITM2AO43736 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITM2AO43736 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITM2AO43736 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITM2AO43736 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITM2AO43736 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITM2AO43736 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITM2AO43736 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITM2AO43736 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITM2AO43736 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITM2AO43736 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITM2AO43736 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ITM2AO43736 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITM2AO43736 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITM2AO43736 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ITM2AO43736 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITM2AO43736 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITM2AO43736 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITM2AO43736 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITM2AO43736 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITM2AO43736 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITM2AO43736 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITM2AO43736 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITM2AO43736 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITM2AO43736 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITM2AO43736 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITM2AO43736 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITM2AO43736 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITM2AO43736 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITM2AO43736 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITM2AO43736 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITM2AO43736 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITM2AO43736 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITM2AO43736 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITM2AO43736 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITM2AO43736 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITM2AO43736 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITM2AO43736 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITM2AO43736 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITM2AO43736 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITM2AO43736 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITM2AO43736 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITM2AO43736 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITM2AO43736 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITM2AO43736 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITM2AO43736 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITM2AO43736 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITM2AO43736 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITM2AO43736 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITM2AO43736 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITM2AO43736 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITM2AO43736 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITM2AO43736 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms