Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PRPF3O43395 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRPF3O43395 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRPF3O43395 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRPF3O43395 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRPF3O43395 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRPF3O43395 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRPF3O43395 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRPF3O43395 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRPF3O43395 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRPF3O43395 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRPF3O43395 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRPF3O43395 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRPF3O43395 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRPF3O43395 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRPF3O43395 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRPF3O43395 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRPF3O43395 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRPF3O43395 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRPF3O43395 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PRPF3O43395 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRPF3O43395 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRPF3O43395 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRPF3O43395 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRPF3O43395 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRPF3O43395 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRPF3O43395 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRPF3O43395 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRPF3O43395 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRPF3O43395 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRPF3O43395 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRPF3O43395 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRPF3O43395 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRPF3O43395 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRPF3O43395 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRPF3O43395 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRPF3O43395 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRPF3O43395 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PRPF3O43395 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRPF3O43395 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRPF3O43395 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRPF3O43395 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRPF3O43395 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRPF3O43395 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PRPF3O43395 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRPF3O43395 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRPF3O43395 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRPF3O43395 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRPF3O43395 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRPF3O43395 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRPF3O43395 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRPF3O43395 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRPF3O43395 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRPF3O43395 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRPF3O43395 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRPF3O43395 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRPF3O43395 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRPF3O43395 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRPF3O43395 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF3O43395 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF3O43395 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF3O43395 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF3O43395 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF3O43395 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF3O43395 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF3O43395 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF3O43395 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF3O43395 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF3O43395 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PRPF3O43395 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRPF3O43395 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRPF3O43395 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRPF3O43395 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRPF3O43395 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRPF3O43395 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRPF3O43395 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PRPF3O43395 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRPF3O43395 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRPF3O43395 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRPF3O43395 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRPF3O43395 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRPF3O43395 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRPF3O43395 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRPF3O43395 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRPF3O43395 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRPF3O43395 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRPF3O43395 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRPF3O43395 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRPF3O43395 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRPF3O43395 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRPF3O43395 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRPF3O43395 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRPF3O43395 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRPF3O43395 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRPF3O43395 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRPF3O43395 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRPF3O43395 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRPF3O43395 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRPF3O43395 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRPF3O43395 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms