Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASKO14936 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASKO14936 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASKO14936 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASKO14936 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASKO14936 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASKO14936 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASKO14936 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASKO14936 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASKO14936 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASKO14936 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASKO14936 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASKO14936 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASKO14936 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASKO14936 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASKO14936 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASKO14936 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASKO14936 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASKO14936 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASKO14936 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASKO14936 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASKO14936 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASKO14936 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASKO14936 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASKO14936 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASKO14936 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASKO14936 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASKO14936 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASKO14936 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CASKO14936 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASKO14936 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASKO14936 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CASKO14936 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASKO14936 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASKO14936 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASKO14936 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASKO14936 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASKO14936 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASKO14936 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CASKO14936 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASKO14936 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASKO14936 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASKO14936 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASKO14936 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASKO14936 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASKO14936 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASKO14936 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASKO14936 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASKO14936 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASKO14936 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASKO14936 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASKO14936 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASKO14936 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASKO14936 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASKO14936 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASKO14936 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASKO14936 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASKO14936 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASKO14936 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASKO14936 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASKO14936 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASKO14936 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASKO14936 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASKO14936 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASKO14936 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASKO14936 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASKO14936 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASKO14936 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASKO14936 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASKO14936 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASKO14936 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASKO14936 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASKO14936 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASKO14936 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASKO14936 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASKO14936 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASKO14936 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASKO14936 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASKO14936 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASKO14936 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASKO14936 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASKO14936 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CASKO14936 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASKO14936 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASKO14936 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASKO14936 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASKO14936 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASKO14936 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASKO14936 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASKO14936 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASKO14936 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASKO14936 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASKO14936 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASKO14936 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASKO14936 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASKO14936 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASKO14936 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASKO14936 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASKO14936 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASKO14936 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms