Protein–RNA interactions for Protein: O00574

CXCR6, C-X-C chemokine receptor type 6, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR6O00574 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR6O00574 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR6O00574 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR6O00574 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCR6O00574 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCR6O00574 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCR6O00574 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCR6O00574 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCR6O00574 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCR6O00574 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCR6O00574 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCR6O00574 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCR6O00574 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCR6O00574 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CXCR6O00574 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXCR6O00574 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXCR6O00574 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCR6O00574 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCR6O00574 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCR6O00574 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCR6O00574 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCR6O00574 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCR6O00574 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXCR6O00574 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXCR6O00574 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXCR6O00574 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXCR6O00574 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCR6O00574 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCR6O00574 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCR6O00574 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCR6O00574 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCR6O00574 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCR6O00574 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCR6O00574 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCR6O00574 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCR6O00574 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCR6O00574 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCR6O00574 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCR6O00574 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCR6O00574 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCR6O00574 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCR6O00574 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCR6O00574 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCR6O00574 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCR6O00574 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCR6O00574 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCR6O00574 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCR6O00574 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCR6O00574 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCR6O00574 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCR6O00574 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCR6O00574 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCR6O00574 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCR6O00574 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCR6O00574 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCR6O00574 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCR6O00574 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCR6O00574 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCR6O00574 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCR6O00574 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCR6O00574 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCR6O00574 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCR6O00574 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXCR6O00574 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXCR6O00574 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXCR6O00574 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXCR6O00574 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXCR6O00574 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCR6O00574 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCR6O00574 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCR6O00574 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCR6O00574 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCR6O00574 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCR6O00574 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCR6O00574 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCR6O00574 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCR6O00574 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCR6O00574 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCR6O00574 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCR6O00574 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCR6O00574 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCR6O00574 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCR6O00574 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCR6O00574 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCR6O00574 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCR6O00574 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCR6O00574 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCR6O00574 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCR6O00574 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCR6O00574 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCR6O00574 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCR6O00574 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCR6O00574 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCR6O00574 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CXCR6O00574 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CXCR6O00574 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CXCR6O00574 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CXCR6O00574 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCR6O00574 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCR6O00574 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms