Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP9YO00507 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP9YO00507 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP9YO00507 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP9YO00507 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP9YO00507 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP9YO00507 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP9YO00507 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP9YO00507 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP9YO00507 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP9YO00507 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP9YO00507 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP9YO00507 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP9YO00507 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP9YO00507 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP9YO00507 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP9YO00507 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP9YO00507 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP9YO00507 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP9YO00507 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP9YO00507 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP9YO00507 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP9YO00507 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP9YO00507 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP9YO00507 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP9YO00507 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP9YO00507 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP9YO00507 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP9YO00507 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP9YO00507 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP9YO00507 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP9YO00507 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP9YO00507 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP9YO00507 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP9YO00507 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP9YO00507 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP9YO00507 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP9YO00507 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP9YO00507 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP9YO00507 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP9YO00507 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP9YO00507 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP9YO00507 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP9YO00507 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP9YO00507 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP9YO00507 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP9YO00507 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP9YO00507 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP9YO00507 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP9YO00507 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP9YO00507 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP9YO00507 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP9YO00507 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP9YO00507 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP9YO00507 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP9YO00507 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP9YO00507 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP9YO00507 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP9YO00507 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP9YO00507 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP9YO00507 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP9YO00507 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP9YO00507 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP9YO00507 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP9YO00507 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP9YO00507 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP9YO00507 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP9YO00507 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP9YO00507 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP9YO00507 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP9YO00507 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP9YO00507 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP9YO00507 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP9YO00507 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP9YO00507 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP9YO00507 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP9YO00507 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP9YO00507 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP9YO00507 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP9YO00507 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP9YO00507 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP9YO00507 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP9YO00507 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP9YO00507 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP9YO00507 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP9YO00507 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP9YO00507 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP9YO00507 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP9YO00507 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP9YO00507 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP9YO00507 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP9YO00507 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP9YO00507 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP9YO00507 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP9YO00507 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP9YO00507 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP9YO00507 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP9YO00507 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP9YO00507 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP9YO00507 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms