Protein–RNA interactions for Protein: H6UMI1

GABARAP, GABARAP-a, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPH6UMI1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GABARAPH6UMI1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABARAPH6UMI1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABARAPH6UMI1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABARAPH6UMI1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABARAPH6UMI1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GABARAPH6UMI1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABARAPH6UMI1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GABARAPH6UMI1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GABARAPH6UMI1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABARAPH6UMI1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GABARAPH6UMI1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABARAPH6UMI1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABARAPH6UMI1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GABARAPH6UMI1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GABARAPH6UMI1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GABARAPH6UMI1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GABARAPH6UMI1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABARAPH6UMI1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABARAPH6UMI1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GABARAPH6UMI1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABARAPH6UMI1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABARAPH6UMI1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GABARAPH6UMI1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABARAPH6UMI1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GABARAPH6UMI1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GABARAPH6UMI1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GABARAPH6UMI1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABARAPH6UMI1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABARAPH6UMI1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABARAPH6UMI1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABARAPH6UMI1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABARAPH6UMI1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABARAPH6UMI1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABARAPH6UMI1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABARAPH6UMI1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABARAPH6UMI1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABARAPH6UMI1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABARAPH6UMI1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABARAPH6UMI1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABARAPH6UMI1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABARAPH6UMI1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABARAPH6UMI1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABARAPH6UMI1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABARAPH6UMI1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GABARAPH6UMI1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABARAPH6UMI1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABARAPH6UMI1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABARAPH6UMI1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABARAPH6UMI1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GABARAPH6UMI1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABARAPH6UMI1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABARAPH6UMI1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABARAPH6UMI1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABARAPH6UMI1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABARAPH6UMI1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABARAPH6UMI1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GABARAPH6UMI1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABARAPH6UMI1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABARAPH6UMI1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABARAPH6UMI1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABARAPH6UMI1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABARAPH6UMI1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABARAPH6UMI1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABARAPH6UMI1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABARAPH6UMI1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABARAPH6UMI1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABARAPH6UMI1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABARAPH6UMI1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABARAPH6UMI1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABARAPH6UMI1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABARAPH6UMI1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABARAPH6UMI1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABARAPH6UMI1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABARAPH6UMI1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABARAPH6UMI1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABARAPH6UMI1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABARAPH6UMI1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABARAPH6UMI1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABARAPH6UMI1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABARAPH6UMI1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABARAPH6UMI1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABARAPH6UMI1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABARAPH6UMI1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABARAPH6UMI1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABARAPH6UMI1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABARAPH6UMI1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABARAPH6UMI1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABARAPH6UMI1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABARAPH6UMI1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABARAPH6UMI1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABARAPH6UMI1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABARAPH6UMI1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABARAPH6UMI1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABARAPH6UMI1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABARAPH6UMI1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABARAPH6UMI1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABARAPH6UMI1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABARAPH6UMI1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABARAPH6UMI1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.9 ms