Protein–RNA interactions for Protein: H3BU86

STX16-NPEPL1, STX16-NPEPL1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX16-NPEPL1H3BU86 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX16-NPEPL1H3BU86 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX16-NPEPL1H3BU86 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX16-NPEPL1H3BU86 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX16-NPEPL1H3BU86 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX16-NPEPL1H3BU86 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX16-NPEPL1H3BU86 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX16-NPEPL1H3BU86 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX16-NPEPL1H3BU86 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX16-NPEPL1H3BU86 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX16-NPEPL1H3BU86 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX16-NPEPL1H3BU86 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX16-NPEPL1H3BU86 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX16-NPEPL1H3BU86 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX16-NPEPL1H3BU86 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX16-NPEPL1H3BU86 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX16-NPEPL1H3BU86 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX16-NPEPL1H3BU86 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX16-NPEPL1H3BU86 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX16-NPEPL1H3BU86 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
STX16-NPEPL1H3BU86 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX16-NPEPL1H3BU86 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX16-NPEPL1H3BU86 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX16-NPEPL1H3BU86 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX16-NPEPL1H3BU86 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX16-NPEPL1H3BU86 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX16-NPEPL1H3BU86 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX16-NPEPL1H3BU86 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STX16-NPEPL1H3BU86 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STX16-NPEPL1H3BU86 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STX16-NPEPL1H3BU86 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STX16-NPEPL1H3BU86 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STX16-NPEPL1H3BU86 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STX16-NPEPL1H3BU86 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STX16-NPEPL1H3BU86 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STX16-NPEPL1H3BU86 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STX16-NPEPL1H3BU86 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX16-NPEPL1H3BU86 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX16-NPEPL1H3BU86 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX16-NPEPL1H3BU86 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX16-NPEPL1H3BU86 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STX16-NPEPL1H3BU86 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STX16-NPEPL1H3BU86 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STX16-NPEPL1H3BU86 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STX16-NPEPL1H3BU86 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STX16-NPEPL1H3BU86 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STX16-NPEPL1H3BU86 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STX16-NPEPL1H3BU86 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STX16-NPEPL1H3BU86 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
STX16-NPEPL1H3BU86 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STX16-NPEPL1H3BU86 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STX16-NPEPL1H3BU86 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STX16-NPEPL1H3BU86 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STX16-NPEPL1H3BU86 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STX16-NPEPL1H3BU86 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX16-NPEPL1H3BU86 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX16-NPEPL1H3BU86 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX16-NPEPL1H3BU86 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX16-NPEPL1H3BU86 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX16-NPEPL1H3BU86 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX16-NPEPL1H3BU86 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX16-NPEPL1H3BU86 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX16-NPEPL1H3BU86 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX16-NPEPL1H3BU86 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX16-NPEPL1H3BU86 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX16-NPEPL1H3BU86 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX16-NPEPL1H3BU86 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX16-NPEPL1H3BU86 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
STX16-NPEPL1H3BU86 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX16-NPEPL1H3BU86 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX16-NPEPL1H3BU86 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX16-NPEPL1H3BU86 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
STX16-NPEPL1H3BU86 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX16-NPEPL1H3BU86 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX16-NPEPL1H3BU86 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX16-NPEPL1H3BU86 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX16-NPEPL1H3BU86 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX16-NPEPL1H3BU86 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX16-NPEPL1H3BU86 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX16-NPEPL1H3BU86 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX16-NPEPL1H3BU86 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
STX16-NPEPL1H3BU86 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX16-NPEPL1H3BU86 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
STX16-NPEPL1H3BU86 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX16-NPEPL1H3BU86 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX16-NPEPL1H3BU86 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX16-NPEPL1H3BU86 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX16-NPEPL1H3BU86 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX16-NPEPL1H3BU86 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX16-NPEPL1H3BU86 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX16-NPEPL1H3BU86 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
STX16-NPEPL1H3BU86 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX16-NPEPL1H3BU86 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms