Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GOLGA8SH3BPF8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GOLGA8SH3BPF8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GOLGA8SH3BPF8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GOLGA8SH3BPF8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GOLGA8SH3BPF8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GOLGA8SH3BPF8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GOLGA8SH3BPF8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GOLGA8SH3BPF8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GOLGA8SH3BPF8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GOLGA8SH3BPF8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GOLGA8SH3BPF8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GOLGA8SH3BPF8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GOLGA8SH3BPF8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GOLGA8SH3BPF8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
GOLGA8SH3BPF8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GOLGA8SH3BPF8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GOLGA8SH3BPF8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GOLGA8SH3BPF8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GOLGA8SH3BPF8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GOLGA8SH3BPF8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GOLGA8SH3BPF8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GOLGA8SH3BPF8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GOLGA8SH3BPF8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GOLGA8SH3BPF8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GOLGA8SH3BPF8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GOLGA8SH3BPF8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GOLGA8SH3BPF8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GOLGA8SH3BPF8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA8SH3BPF8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA8SH3BPF8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA8SH3BPF8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA8SH3BPF8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA8SH3BPF8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA8SH3BPF8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA8SH3BPF8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GOLGA8SH3BPF8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA8SH3BPF8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GOLGA8SH3BPF8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA8SH3BPF8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA8SH3BPF8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA8SH3BPF8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA8SH3BPF8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA8SH3BPF8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA8SH3BPF8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA8SH3BPF8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GOLGA8SH3BPF8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOLGA8SH3BPF8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOLGA8SH3BPF8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOLGA8SH3BPF8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOLGA8SH3BPF8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOLGA8SH3BPF8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOLGA8SH3BPF8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOLGA8SH3BPF8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOLGA8SH3BPF8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GOLGA8SH3BPF8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GOLGA8SH3BPF8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GOLGA8SH3BPF8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GOLGA8SH3BPF8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GOLGA8SH3BPF8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GOLGA8SH3BPF8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GOLGA8SH3BPF8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GOLGA8SH3BPF8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOLGA8SH3BPF8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOLGA8SH3BPF8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOLGA8SH3BPF8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GOLGA8SH3BPF8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GOLGA8SH3BPF8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GOLGA8SH3BPF8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GOLGA8SH3BPF8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
GOLGA8SH3BPF8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA8SH3BPF8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA8SH3BPF8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA8SH3BPF8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA8SH3BPF8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA8SH3BPF8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA8SH3BPF8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOLGA8SH3BPF8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOLGA8SH3BPF8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOLGA8SH3BPF8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOLGA8SH3BPF8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOLGA8SH3BPF8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOLGA8SH3BPF8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOLGA8SH3BPF8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOLGA8SH3BPF8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA8SH3BPF8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA8SH3BPF8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA8SH3BPF8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA8SH3BPF8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA8SH3BPF8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA8SH3BPF8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA8SH3BPF8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA8SH3BPF8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA8SH3BPF8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA8SH3BPF8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA8SH3BPF8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA8SH3BPF8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA8SH3BPF8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA8SH3BPF8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA8SH3BPF8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms