Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEDD8-MDP1E9PL57 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEDD8-MDP1E9PL57 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEDD8-MDP1E9PL57 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NEDD8-MDP1E9PL57 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEDD8-MDP1E9PL57 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEDD8-MDP1E9PL57 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEDD8-MDP1E9PL57 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEDD8-MDP1E9PL57 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEDD8-MDP1E9PL57 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEDD8-MDP1E9PL57 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEDD8-MDP1E9PL57 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NEDD8-MDP1E9PL57 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEDD8-MDP1E9PL57 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEDD8-MDP1E9PL57 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEDD8-MDP1E9PL57 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEDD8-MDP1E9PL57 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEDD8-MDP1E9PL57 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEDD8-MDP1E9PL57 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEDD8-MDP1E9PL57 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEDD8-MDP1E9PL57 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD8-MDP1E9PL57 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD8-MDP1E9PL57 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD8-MDP1E9PL57 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD8-MDP1E9PL57 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD8-MDP1E9PL57 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD8-MDP1E9PL57 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD8-MDP1E9PL57 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD8-MDP1E9PL57 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD8-MDP1E9PL57 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NEDD8-MDP1E9PL57 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEDD8-MDP1E9PL57 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEDD8-MDP1E9PL57 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEDD8-MDP1E9PL57 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEDD8-MDP1E9PL57 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEDD8-MDP1E9PL57 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEDD8-MDP1E9PL57 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEDD8-MDP1E9PL57 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NEDD8-MDP1E9PL57 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEDD8-MDP1E9PL57 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1E9PL57 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1E9PL57 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1E9PL57 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1E9PL57 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1E9PL57 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1E9PL57 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1E9PL57 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1E9PL57 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms