Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25■■□□□ 1.59
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms