Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCRIP1C9JLW8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCRIP1C9JLW8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCRIP1C9JLW8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCRIP1C9JLW8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MCRIP1C9JLW8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCRIP1C9JLW8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCRIP1C9JLW8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCRIP1C9JLW8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCRIP1C9JLW8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MCRIP1C9JLW8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MCRIP1C9JLW8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCRIP1C9JLW8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCRIP1C9JLW8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MCRIP1C9JLW8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCRIP1C9JLW8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MCRIP1C9JLW8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCRIP1C9JLW8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MCRIP1C9JLW8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCRIP1C9JLW8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MCRIP1C9JLW8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MCRIP1C9JLW8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCRIP1C9JLW8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCRIP1C9JLW8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCRIP1C9JLW8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MCRIP1C9JLW8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MCRIP1C9JLW8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCRIP1C9JLW8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MCRIP1C9JLW8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCRIP1C9JLW8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCRIP1C9JLW8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCRIP1C9JLW8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCRIP1C9JLW8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MCRIP1C9JLW8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MCRIP1C9JLW8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCRIP1C9JLW8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCRIP1C9JLW8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCRIP1C9JLW8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCRIP1C9JLW8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCRIP1C9JLW8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCRIP1C9JLW8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCRIP1C9JLW8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCRIP1C9JLW8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCRIP1C9JLW8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCRIP1C9JLW8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCRIP1C9JLW8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCRIP1C9JLW8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCRIP1C9JLW8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCRIP1C9JLW8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCRIP1C9JLW8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCRIP1C9JLW8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCRIP1C9JLW8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCRIP1C9JLW8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCRIP1C9JLW8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCRIP1C9JLW8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCRIP1C9JLW8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MCRIP1C9JLW8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCRIP1C9JLW8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCRIP1C9JLW8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCRIP1C9JLW8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCRIP1C9JLW8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCRIP1C9JLW8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCRIP1C9JLW8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCRIP1C9JLW8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCRIP1C9JLW8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCRIP1C9JLW8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCRIP1C9JLW8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCRIP1C9JLW8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCRIP1C9JLW8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCRIP1C9JLW8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCRIP1C9JLW8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MCRIP1C9JLW8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MCRIP1C9JLW8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MCRIP1C9JLW8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MCRIP1C9JLW8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MCRIP1C9JLW8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MCRIP1C9JLW8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MCRIP1C9JLW8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MCRIP1C9JLW8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MCRIP1C9JLW8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MCRIP1C9JLW8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MCRIP1C9JLW8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MCRIP1C9JLW8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MCRIP1C9JLW8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MCRIP1C9JLW8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MCRIP1C9JLW8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MCRIP1C9JLW8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MCRIP1C9JLW8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MCRIP1C9JLW8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MCRIP1C9JLW8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MCRIP1C9JLW8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCRIP1C9JLW8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCRIP1C9JLW8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCRIP1C9JLW8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCRIP1C9JLW8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCRIP1C9JLW8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MCRIP1C9JLW8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCRIP1C9JLW8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCRIP1C9JLW8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCRIP1C9JLW8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms