Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SRRM5B3KS81 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRRM5B3KS81 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRRM5B3KS81 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRRM5B3KS81 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRRM5B3KS81 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRRM5B3KS81 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRRM5B3KS81 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRRM5B3KS81 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRRM5B3KS81 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRRM5B3KS81 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRRM5B3KS81 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRRM5B3KS81 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRRM5B3KS81 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRRM5B3KS81 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRRM5B3KS81 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms