Protein–RNA interactions for Protein: B2RXH2

KDM4E, Lysine-specific demethylase 4E, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4EB2RXH2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM4EB2RXH2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM4EB2RXH2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM4EB2RXH2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM4EB2RXH2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM4EB2RXH2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM4EB2RXH2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM4EB2RXH2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM4EB2RXH2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM4EB2RXH2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM4EB2RXH2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM4EB2RXH2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM4EB2RXH2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM4EB2RXH2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM4EB2RXH2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM4EB2RXH2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM4EB2RXH2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM4EB2RXH2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM4EB2RXH2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM4EB2RXH2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM4EB2RXH2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM4EB2RXH2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM4EB2RXH2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM4EB2RXH2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM4EB2RXH2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM4EB2RXH2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM4EB2RXH2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM4EB2RXH2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM4EB2RXH2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM4EB2RXH2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM4EB2RXH2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM4EB2RXH2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM4EB2RXH2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM4EB2RXH2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM4EB2RXH2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM4EB2RXH2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM4EB2RXH2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM4EB2RXH2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM4EB2RXH2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM4EB2RXH2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM4EB2RXH2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM4EB2RXH2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM4EB2RXH2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM4EB2RXH2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM4EB2RXH2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM4EB2RXH2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM4EB2RXH2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM4EB2RXH2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM4EB2RXH2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM4EB2RXH2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM4EB2RXH2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM4EB2RXH2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM4EB2RXH2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM4EB2RXH2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM4EB2RXH2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM4EB2RXH2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM4EB2RXH2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM4EB2RXH2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM4EB2RXH2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM4EB2RXH2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM4EB2RXH2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM4EB2RXH2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM4EB2RXH2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM4EB2RXH2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM4EB2RXH2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM4EB2RXH2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM4EB2RXH2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM4EB2RXH2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM4EB2RXH2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM4EB2RXH2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM4EB2RXH2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM4EB2RXH2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM4EB2RXH2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM4EB2RXH2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM4EB2RXH2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM4EB2RXH2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM4EB2RXH2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM4EB2RXH2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM4EB2RXH2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM4EB2RXH2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM4EB2RXH2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM4EB2RXH2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM4EB2RXH2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM4EB2RXH2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM4EB2RXH2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM4EB2RXH2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM4EB2RXH2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM4EB2RXH2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM4EB2RXH2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM4EB2RXH2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM4EB2RXH2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM4EB2RXH2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM4EB2RXH2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM4EB2RXH2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM4EB2RXH2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM4EB2RXH2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM4EB2RXH2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM4EB2RXH2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4EB2RXH2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4EB2RXH2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms