Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU0

FAM187A, Ig-like V-type domain-containing protein FAM187A, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187AA6NFU0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM187AA6NFU0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM187AA6NFU0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM187AA6NFU0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM187AA6NFU0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM187AA6NFU0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM187AA6NFU0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM187AA6NFU0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM187AA6NFU0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM187AA6NFU0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM187AA6NFU0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM187AA6NFU0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM187AA6NFU0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM187AA6NFU0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM187AA6NFU0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM187AA6NFU0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FAM187AA6NFU0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FAM187AA6NFU0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM187AA6NFU0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM187AA6NFU0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM187AA6NFU0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM187AA6NFU0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM187AA6NFU0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM187AA6NFU0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM187AA6NFU0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM187AA6NFU0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM187AA6NFU0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM187AA6NFU0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM187AA6NFU0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM187AA6NFU0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM187AA6NFU0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM187AA6NFU0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM187AA6NFU0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM187AA6NFU0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM187AA6NFU0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM187AA6NFU0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM187AA6NFU0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM187AA6NFU0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM187AA6NFU0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM187AA6NFU0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM187AA6NFU0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
FAM187AA6NFU0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FAM187AA6NFU0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM187AA6NFU0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM187AA6NFU0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM187AA6NFU0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM187AA6NFU0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM187AA6NFU0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM187AA6NFU0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM187AA6NFU0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM187AA6NFU0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM187AA6NFU0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM187AA6NFU0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM187AA6NFU0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM187AA6NFU0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM187AA6NFU0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM187AA6NFU0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM187AA6NFU0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM187AA6NFU0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM187AA6NFU0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM187AA6NFU0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM187AA6NFU0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM187AA6NFU0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM187AA6NFU0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM187AA6NFU0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM187AA6NFU0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM187AA6NFU0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM187AA6NFU0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM187AA6NFU0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM187AA6NFU0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM187AA6NFU0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM187AA6NFU0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM187AA6NFU0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM187AA6NFU0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM187AA6NFU0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM187AA6NFU0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM187AA6NFU0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM187AA6NFU0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM187AA6NFU0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM187AA6NFU0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM187AA6NFU0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM187AA6NFU0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM187AA6NFU0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM187AA6NFU0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM187AA6NFU0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM187AA6NFU0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM187AA6NFU0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM187AA6NFU0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM187AA6NFU0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM187AA6NFU0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM187AA6NFU0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM187AA6NFU0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM187AA6NFU0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM187AA6NFU0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM187AA6NFU0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM187AA6NFU0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM187AA6NFU0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM187AA6NFU0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM187AA6NFU0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM187AA6NFU0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms