Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PSDA5PKW4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PSDA5PKW4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PSDA5PKW4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PSDA5PKW4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PSDA5PKW4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
PSDA5PKW4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PSDA5PKW4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PSDA5PKW4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PSDA5PKW4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PSDA5PKW4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PSDA5PKW4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PSDA5PKW4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PSDA5PKW4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PSDA5PKW4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PSDA5PKW4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PSDA5PKW4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PSDA5PKW4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PSDA5PKW4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PSDA5PKW4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PSDA5PKW4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PSDA5PKW4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PSDA5PKW4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PSDA5PKW4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PSDA5PKW4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PSDA5PKW4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PSDA5PKW4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PSDA5PKW4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PSDA5PKW4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PSDA5PKW4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PSDA5PKW4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PSDA5PKW4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PSDA5PKW4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PSDA5PKW4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PSDA5PKW4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PSDA5PKW4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PSDA5PKW4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PSDA5PKW4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PSDA5PKW4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PSDA5PKW4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PSDA5PKW4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
PSDA5PKW4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PSDA5PKW4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PSDA5PKW4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PSDA5PKW4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PSDA5PKW4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PSDA5PKW4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PSDA5PKW4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
PSDA5PKW4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
PSDA5PKW4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
PSDA5PKW4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PSDA5PKW4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PSDA5PKW4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PSDA5PKW4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PSDA5PKW4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PSDA5PKW4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PSDA5PKW4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PSDA5PKW4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PSDA5PKW4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PSDA5PKW4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PSDA5PKW4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PSDA5PKW4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PSDA5PKW4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
PSDA5PKW4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
PSDA5PKW4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PSDA5PKW4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PSDA5PKW4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PSDA5PKW4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PSDA5PKW4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PSDA5PKW4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PSDA5PKW4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PSDA5PKW4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PSDA5PKW4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PSDA5PKW4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PSDA5PKW4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PSDA5PKW4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
PSDA5PKW4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PSDA5PKW4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PSDA5PKW4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PSDA5PKW4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
PSDA5PKW4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PSDA5PKW4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PSDA5PKW4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PSDA5PKW4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PSDA5PKW4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PSDA5PKW4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PSDA5PKW4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
PSDA5PKW4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PSDA5PKW4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PSDA5PKW4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PSDA5PKW4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PSDA5PKW4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PSDA5PKW4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PSDA5PKW4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PSDA5PKW4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PSDA5PKW4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PSDA5PKW4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PSDA5PKW4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
PSDA5PKW4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PSDA5PKW4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms